R - 在 x 和 y 轴上使用具有不同变量的 corrplot

Question

大家可能都知道，corrplot 可用于创建漂亮的图，可视化一组变量之间的关系强度，x 轴上的变量与 y 轴上的变量相同（通常是对称的，除非您的上对角线与下对角线的度量标准不同）。我想以稍微不同的方式使用 corrplot。

假设我有一个如下所示的数据框：

var1 var2 beta  se   pvalue
X    a    .01   .01  .35
X    b    -.02  .02  .45
X    c    .04   .01  .55
X    d    .04   .01  .55
Y    a    .06   .01  .01
Y    b    -.02  .02  .25
Y    c    .04   .01  .55
Y    d    .02   .01  .55
Z    a    .04   .01  .01
Z    b    -.01  .01  .45
Z    c    .03   .02  .02
Z    d    .04   .02  .02

我可以使用 corrplot 创建一个图形，其中变量 X、Y 和 Z 在 x 轴上，a、b、c 和 d 在 Y 轴上？如果是，怎么做？

PS。我要绘制的值是 beta。

编辑：我将示例文件编辑为相对于 x 和 y 上的变量的 nr 是非对称的

Answer 1

您可以将数据重新整形为方阵，然后将其输入corrplot。 即使生成的矩阵不是方形的，这也有效。

## Your new data
Dat = read.table(text="var1 var2 beta  se   pvalue
X    a    .01   .01  .35
X    b    -.02  .02  .45
X    c    .04   .01  .55
X    d    .04   .01  .55
Y    a    .06   .01  .01
Y    b    -.02  .02  .25
Y    c    .04   .01  .55
Y    d    .02   .01  .55
Z    a    .04   .01  .01
Z    b    -.01  .01  .45
Z    c    .03   .02  .02
Z    d    .04   .02  .02",
header=TRUE)

## Now reshape the data  (same as before)
wide = reshape(Dat[,1:3], idvar = c("var1"),
    timevar="var2", direction = "wide")
rownames(wide) = wide$var1
wide = wide[,-1]
colnames(wide) = sub("beta.", "", colnames(wide))

## Pass it to corrplot
library(corrplot)
corrplot(as.matrix(wide), is.corr=FALSE, tl.srt=0)