如何从服务器上的 bash 脚本在虚拟环境中执行脚本？

Question

我正在尝试使用 oarsub 在服务器的虚拟环境中运行 python 脚本：

所以首先我在服务器名称“a”中运行这个命令：

oarsub -l /host=1/gpu=1,walltime=2:00:00 './training_corpus1.sh'

training_corpus1.sh 一开始是这样的：

#!/bin/bash

cd /home/ge/ke/anaconda3/envs

source activate env

cd ~/eXP/bert

CUDA_VISIBLE_DEVICES=0,1 python training.py \
    --exp_name bert \ ...

在开始时，我想打开我的虚拟环境，然后运行脚本，但我总是在 OAR.18651.stderr 文件中收到此错误：

./training_corpus1.sh: line 5: activate: No such file or directory
Traceback (most recent call last):
  File "training.py", line 18, in <module>
    from xlm.slurm import init_signal_handler, init_distributed_mode
  File "/home/ge/ke/eXP/bert/xlm/slurm.py", line 11, in <module>
    import torch
ImportError: No module named torch

Torch 位于我的虚拟环境中，它似乎没有打开。当使用“conda”时，我得到了一个“源”的位置：

./training_corpus1.sh: line 5: conda: command not found

Answer 1

对于虚拟环境和bash，激活命令是

source env/bin/activate

其中env是要激活的虚拟环境的目录。

PS。让我建议您使用 set -e 启动任何脚本，以便在任何错误时快速失败：

#!/usr/bin/env bash
set -e
…