R中data.table的命名列答案

【问题标题】：Naming columns for data.table in RR中data.table的命名列
【发布时间】：2014-08-05 02:17:52
【问题描述】：

我有一个表格的 data.table

   nrow    V1      V2        V3      V4        V5  V6 V7                  V8
 1:    1 chr20     C4b   6382078     C4b   6381944 reg  - Thymus_M_GSM1328751
 2:    2  chr8    Rpl4  68832532    Rpl4  68832743 reg  + Thymus_M_GSM1328751

我想将列命名为（“Chromosome”、“Start_Gene”、“startPosition”、“End_gene”、“endPosition”、“RNAtype”、“strand”、“replicate”）。我试过了：

ratData <- ratData[, by= list("Chromosome", "Start_Gene","startPosition", "End_gene", "endPosition", "RNAtype", "strand", "replicate")]

但它不起作用。我也试过 key 而不是“by”。

我该怎么做？

【问题讨论】：

标签： r data.table

【解决方案1】：

您可以使用setnames 函数来更改列名。

setnames(ratData, c("nrow", "Chromosome", "Start_Gene","startPosition", "End_gene", 
                    "endPosition", "RNAtype", "strand", "replicate"))

这里有几个变体：

setnames(ratData, 
         paste0("V", 1:8), # i.e. c("V1", "V2", ..., "V8")
         c("Chromosome", "Start_Gene","startPosition", "End_gene", 
           "endPosition", "RNAtype", "strand", "replicate"))

setnames(ratData, 
         2:9,
         c("Chromosome", "Start_Gene","startPosition", "End_gene", 
            "endPosition", "RNAtype", "strand", "replicate"))

【讨论】：

我认为应该是setNames，大写N
@ElPresidente 不，setnames 是一个 data.table 函数，它不会在内存中制作任何副本。
如果你使用paste0那么你就不需要collapse=""
@DeanMacGregor 哎呀。那应该是sep="" 而不是collapse=""，在这种情况下你是对的，我可以使用paste0 代替。我会更新的。

【解决方案2】：

'names' 功能也可以：

names(ratData)
[1] "nrow" "V1"   "V2"   "V3"   "V4"   "V5"   "V6"   "V7"   "V8"  

names(ratData) = c("nrow", "Chromosome", "Start_Gene","startPosition", "End_gene", "endPosition", "RNAtype", "strand", "replicate")

ratData
   nrow Chromosome Start_Gene startPosition End_gene endPosition RNAtype strand           replicate
1:    1      chr20        C4b       6382078      C4b     6381944     reg      0 Thymus_M_GSM1328751
2:    2       chr8       Rpl4      68832532     Rpl4    68832743     reg      0 Thymus_M_GSM1328751

【讨论】：

如果我没记错的话，这会产生多个数据副本，因此虽然它有效，但它可能不是最好的方法。来自“data.table”的setnames 也适用于data.frames。