【发布时间】：2020-06-29 03:22:26
【问题描述】：
我有一个这样的 fasta 文件：
>rna-XM_00001.1
actact
>rna-XM_00002.1
atcatc
如何删除“rna-”使其变为
>XM_00001.1
actact
>XM_00002.1
atcatc
【问题讨论】：
【发布时间】：2020-06-29 03:22:26
【问题描述】：
您显示的是文件内容？那么 sed 应该可以做到这一点：
sed 's/^>rna-/>/' < inputfile > outputfile
解释：
- sed 命令行的第一个字符是
s，它告诉 sed 进行替换 -
/是分隔符 -
^告诉 sed 只查看行首 - 下一个
>rna-是匹配行首的模式 - 下一个
>是替换模式的替换
如果您希望始终删除 > 之后的前四个字符，只要它们以 - 结尾，您可以使用：
sed 's/^>...-/>/' < inputfile > outputfile
解释：
- 这与上面类似，除了在行首匹配的模式是
>...-。该模式是一个正则表达式，其中.匹配任何单个字符。所以这个模式匹配任何以>开头的行，后跟任意三个字符，然后是-。
【讨论】：
-
感谢您的详细解释。它完成了工作。