【问题标题】:How to link permanently MKL libraries to Numpy in Linux? [closed]如何在 Linux 中将 MKL 库永久链接到 Numpy? [关闭]
【发布时间】:2012-09-04 16:11:10
【问题描述】:

我使用英特尔的 MKL 库构建了 Numpy(对我来说这是一个艰难的过程,我花了一整天的时间!)。 Numpy 需要使用 LD_LIBRARY_PATH 环境变量链接到 MKL 库,或者至少这是我这样做的方式......所以我在 .bashrc 中使用 export 来保存路径,当我启动新控制台并运行 python 时, Numpy 已正确加载库。

问题在于它不适用于我使用 Pydev 开发程序的 Eclipse。我仍然可以在 Eclipse 的首选项中的某处添加 LD_LIBRARY_PATH,但是当我尝试安装 Scipy 时问题变得真实。 Scipy 的安装脚本需要导入 Numpy,即使正确设置了 LD_LIBRARY_PATH,我仍然遇到无法导入的 MKL 库的错误:

$ sudo python setup.py install
Traceback (most recent call last):
  File "setup.py", line 208, in <module>
    setup_package()
  File "setup.py", line 145, in setup_package
    from numpy.distutils.core import setup
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
    import add_newdocs
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
    from numpy.lib import add_newdoc
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
    from type_check import *
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
    import numpy.core.numeric as _nx
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
    import multiarray
ImportError: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory

libimf.so 是我必须链接的 MKL 共享库之一。 除了直接修改 Numpy 的 __init__.py 文件(我宁愿避免这样做,因为可能有更简洁的方法),我不知道如何将 Numpy 永久链接到 MKL 库。

感谢您的帮助!

【问题讨论】:

  • 阅读 ldconfig 手册页。
  • 就是这样!有用!谢谢!
  • 我不明白为什么这个问题跑题了……有人给我解释一下?

标签: python linux numpy shared-libraries intel-mkl


【解决方案1】:

感谢 Talonmies 的评论,我找到了这样做的方法! 必须编辑文件/etc/ld.so.conf 并添加库的路径。 以下是我如何找到需要添加的路径(这是非常经验的......):

每当我在使用 Numpy 时遇到与无法导入的库相关的错误时,我都会以这种方式查找该库的路径:

find /opt/intel -name library.so

我得到例如路径: /opt/intel/path/to/library.so

我将此行添加到文件/etc/ld.so.conf

include /etc/ld.so.conf.d/*.conf

# Manually added lines
/opt/intel/path/to/library.so

然后运行 ​​ldconfig 以“链接”这些库!

干杯!并感谢 Talonmies!

【讨论】:

  • 谢谢,当我将目录而不是共享对象文件本身添加到 ld.so.conf 时,这对我有用。
  • include /etc/ld.so.conf.d/中添加一个.conf文件不是更好吗?说include /etc/ld.so.conf.d/mylibs.conf,避免编辑include /etc/ld.so.conf,它会自动检测目录中的所有conf文件。
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