从列表中加载 r 中的稀疏矩阵

Question

您好，我有一个结构如下的文件

12    45    56
34    65    31
12    23    43

等等我有一个巨大的数据集

所以我有一个包含 3 列的文本文件，但是，我想要创建稀疏矩阵的方式是，对于每一行说 12 45 56..... 第一个数字，即行第二个数字，即 45 是列和第三number(i.e. 56) 是稀疏矩阵第 12 行第 45 列的值

我做以下事情

>x = scan('data.txt',what=list(integer(),integer(),numeric()))
Read 61944406 records

> library('Matrix')
Loading required package: lattice
N
> N= sparseMatrix(i=x[[1]],j=x[[2]],x=x[[3]])

但我收到此错误

Error in validObject(r) : 
invalid class “dgTMatrix” object: all row indices (slot 'i') must be between 0 and nrow-1 in a TsparseMatrix

谁能帮我弄清楚我做错了什么？

Answer 1

我遇到了完全相同的问题，在尝试了很多方法后，解决方案来自阅读 sparseMatrix 函数的帮助。参数 index1 指定索引是从 1 开始还是从 0 开始。

N= sparseMatrix(i=x[[1]],j=x[[2]],x=x[[3]], index1=FALSE)

Answer 2

当您使用x[[1]] 时，您指的是x 矩阵的第一个元素，在本例中为x[[1]]=12。如果您需要索引列，则必须使用 x[,1] 或对行使用 x[1,]。 试试这个：

x = matrix(c(12,45,56,
             34,65,31,
             12,23,43), nrow=3, byrow=TRUE)

N= sparseMatrix(i=x[,1], j=x[,2], x=x[,3])

已编辑：我已重现您的错误：

x = matrix(c( 0,45,56,
             34,65,31,
             12,23,43), nrow=3, byrow=TRUE)

N= sparseMatrix(i=x[,1], j=x[,2], x=x[,3])
Error en validObject(r) : 
  invalid class “dgTMatrix” object: all row indices (slot 'i') must be between 0 and nrow-1 in a TsparseMatrix

所以，请确保你的前 2 个列中没有 0