【发布时间】：2018-03-14 05:07:43
【问题描述】：
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("BSgenome")
“存储库中没有包（没有互联网连接？）”尝试时 http://bioconductor.org/packages/3.2/bioc，尝试http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc 错误：存储库中没有包（没有互联网连接？）
我尝试使用其他可用的解决方案，但无法对问题进行排序。请帮忙。
谢谢
我在使用sessionInfo()时得到了这个
系统错误（粘贴（其中，shQuote（名称[i]）），实习生= TRUE，ignore.stderr = TRUE）：无法打开'/usr/bin/which'uname' 2>/dev/null' ，可能的原因“无法分配内存”
【问题讨论】：
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我假设您已连接到互联网。您可以编辑您的问题以包含
sessionInfo()的输出吗？ -
我在使用 sessionInfo() 时得到这个错误在系统中（paste(which, shQuote(names[i])), intern = TRUE, ignore.stderr = TRUE) : cannot popen '/usr /bin/which 'uname' 2>/dev/null'，可能的原因'无法分配内存'
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退出 R（不保存工作区），重新启动，然后再次尝试获取上述命令。另外，不要将代码输出放在 cmets 中。始终edit您的问题以包含更多详细信息。
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我无法退出 R，因为我将大文件扫描到需要进一步编码的环境中。我已经上传了两个大约 18GB 的文件。我想问题就是因为这个而出现的。
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手动保存关键文件/对象（例如使用
save），然后退出。如果sessionInfo()抱怨无法分配内存，那么您当前的 R 会话显然有问题。biocLite的问题很可能与此有关。
标签： r bioconductor