Rstudio/Rstudio Server 上的 Linux 内存分配

Question

我正在尝试在 Linux 上使用 Rstudio 使用 CLARA 进行集群，我有一个非常大的数据集。

但是，整个数据集的内存似乎不够？

## Estimating the number of clusters ----
fviz_nbclust(df, clara, method = "silhouette", k.max = 15)

它向我展示了这个：

错误：无法分配大小为 339.8 GB 的向量

所以我尝试了所有这些，但仍然没有用。 memory.limit 也仅适用于 Windows（我仍然尝试过）。

# devtools::install_github("krlmlr/ulimit")
# gc() 
# memory.limit(9999999999)
# 
# 
# install.packages("devtools", dependencies = TRUE)
# devtools::install_github("krlmlr/ulimit")
# ulimit::memory_limit(2000)
# 
# devtools::install_github("jeroen/unix")
# 
# 
# if(.Platform$OS.type == "windows") withAutoprint({
#   memory.size()
#   memory.size(TRUE)
#   memory.limit()
# })
# memory.limit(size=56000)
# memory.size(max = FALSE)

有人可以帮我吗？

任何帮助将不胜感激！

Answer 1

该错误仅表示它无法为您的 RAM 分配 339.8 GB。你有 360GB 的内存吗？

如果没有，您只需 dplyr::nsample() 并在数据集的子集上运行该函数。