【问题标题】:Plotting different types of bar graph ggplot绘制不同类型的条形图 ggplot
【发布时间】:2013-02-25 03:36:33
【问题描述】:

我正在尝试绘制此data 的条形图

目前我写的R脚本如下:

library(ggplot2)
f<-read.table("Coverage_test", sep="\t", header=TRUE)
f$Coverage <- factor(f$Coverage, levels=unique(as.character(f$Coverage)))
g = ggplot(data=f, aes(x=Coverage, y=Variable_counts, group=Form, fill=Type)) 
+ geom_bar(position="dodge", stat="identity", colour="black") 
+ facet_grid( ~ Sample_name, scales="free") + opts(title = "Coverage", axis.text.x = theme_text(angle = 90, hjust = 1, size = 8, colour = "grey50")) 
+ ylab("Number of variables") + scale_fill_hue() + scale_y_continuous(formatter="comma")
ggsave("Figure_test_coverage.pdf")

这段代码的输出如下:

我的问题是: 有没有办法显示基于图形的两个变量的行为差异。每个 x 轴变量都有四个条形。我已经选择用“类型”填充颜色,这显示了不同的“类型”(一个变量)在我的数据中的行为方式。但我也想展示变量“表单”在我的数据中的行为。我已将它们分组在我的代码“group=Form”中,但无法在实际图表中区分它(视觉上)。这可以通过显示一个变量的不同颜色和另一个变量的不同线型(实线和虚线)来在线图中完成。如下所示: 。

我想知道“表单”变量是否可以用不同的颜色显示,或者至少可以在它们各自的条形下方命名或任何可能的名称? 非常感谢任何帮助。

谢谢。

【问题讨论】:

    标签: r ggplot2


    【解决方案1】:

    我想你想要这样的东西:

    ggplot(data=dat, aes(x=Coverage, 
                            y=Variable_counts, 
                             group=interaction(Form,Type), 
                             fill=interaction(Form,Type))) +
     geom_bar(position="dodge", stat="identity", colour="black")
    

    编辑

    由于条形图和 samrt 公式表示法,我会在这里使用格子。为了好玩,我使用 latticeExtra 使用类似 ggplot 的主题。

    library(latticeExtra)
    barchart(Variable_counts~Coverage|Sample_name,
             groups=interaction(Type,Form),
             data=dat,stack=F,auto.key=list(columns = 4),
             par.settings = ggplot2like(),
             axis = axis.grid,
             between=list(x=2))
    

    【讨论】:

      猜你喜欢
      • 1970-01-01
      • 1970-01-01
      • 2011-10-14
      • 1970-01-01
      • 1970-01-01
      • 2018-11-18
      • 1970-01-01
      • 2022-11-23
      • 1970-01-01
      相关资源
      最近更新 更多