构建共享库时发生 Knitr 和 Rcpp 错误 1 ​​[重复]

Question

我目前正在使用 Windows 计算机，但在与 knitr 和 Rcpp 交互时遇到了一些问题。

我的代码在 Rstudio 上运行时运行良好，但是当我尝试使用 knitr 创建 html 文件时，出现错误：

当我删除该行时创建 html 文件有效，因此在 Rcpp 或 knitr 包中似乎都不是问题。

另外，我从未在代码中使用过 sourceCPP 函数，而是使用 cppFunction（以 C 代码为字符串的变量）。

根据需要，我创建了一个简化的示例，脚本“cppcode.R”如下：

library(Rcpp)
library(RcppArmadillo)

ccode = "
NumericMatrix rand_mat(NumericVector dim){
  IntegerVector v = seq_len(2) - 1;
  int N = dim[0];
  int M = dim[1];
  NumericMatrix Y(N,M);
  for(int i=0;i<N;i++){
    for(int j=0;j<M;j++){
      Y(i,j) = sample(v,1,true)[0];
    }
  }
  return Y;
}
"

cppFunction(code=ccode,depends="RcppArmadillo")

然后是Rmd文件：

#This is an example
```{r}
source("cppcode.R")
rand_mat(c(3,3))
```

如果只是在 Rstudio 上运行这些行，但当我按下 knit 按钮时给我同样的错误。

Answer 1

好吧，在查看here 之后，我发现它可能与 Rtools 相关。似乎在 knitr 中运行的 R 会话对于“查找 Rtools”的灵活性较低，因此它不起作用。我不确定这是否有意义。

如果其他人遇到此问题，我发现的一个简单解决方法是在调用 cppFunction 之前将以下行添加到 Rmd 文件中（确保位置 RBuildTools 在 PATH 上）。它会在尝试编译之前找到 Rtools。

library(devtools)
find_rtools()

如果其他人对正在发生的事情以及如何修复它有更技术性的解释，以便我不必将这些行添加到每个文件中，我将不胜感激。