在 Rmarkdown HTML 输出中抑制来自 RStan 的运行消息答案

【问题标题】：Suppress running messages from RStan in Rmarkdown HTML output在 Rmarkdown HTML 输出中抑制来自 RStan 的运行消息
【发布时间】：2017-11-03 21:04:37
【问题描述】：

以下是我的 r 代码。

```{r message=FALSE, warning=FALSE, cache=0,eval=TRUE, error=FALSE}
stan_m1 <- rethinking::map2stan(
  alist(
    y ~ dbinom(n, p),
    logit(p) <- alpha + bP*P + bA*A + bV*V,
    alpha ~ dnorm(0, 10),
    bP ~ dnorm(0, 5),
    bA ~ dnorm(0, 5),
    bV ~ dnorm(0, 5)
  ),
  data = d1, chains=2 , iter=2500 , warmup=500, debug=FALSE , 
  verbose=FALSE,refresh=-1
)

当我将knit 我的rmarkdown 文件作为html 输出时，我得到以下输出。有什么办法可以关闭这些消息？

【问题讨论】：

标签： r knitr r-markdown stan

【解决方案1】：

将results="hide" 放在你的块头中。

而且，在 rstan 2.18.2 或更高版本中，您可以指定 refresh = 0 参数来完成同样的事情。

【讨论】：

哦，在我偶然发现这个答案之前我遭受的痛苦！谢谢。