mclapply 附加参数

Question

我创建了一个函数 DevCstat()。

它接受参数：indat、mod、Covar、txtMat、PatCovar。

indat 是一个列表，我想将该函数应用于列表的每个元素。

mod、Covar、txtMat、PatCovar 是我想在每次调用函数时使用的对象，它们不会改变列表元素。

这似乎有效：

lapply(test, DevCstat, mod='A', Covar=Covar,txtMat=txtMat, PatCovar=PatCovar)

但是并行版不行：

mclapply(test,DevCstat,mod = 'A', Covar=Covar, txtMat=txtMat, PatCovar=PatCovar, SIMPLIFY = F, mc.cores = getOption("mc.cores", numcore))

我得到了错误

all scheduled cores encountered errors in the user code

我认为问题在于 mclapply 没有传递额外的参数。

有谁知道如何正确地做到这一点？

谢谢

Answer 1

您可以从以下示例中看到mclapply 确实允许以这种方式添加额外参数：

mclapply(2:4, function(i,j,k) c(i,j,k), i=1, k=5)

我认为您的问题是 mclapply 不接受 SIMPLIFY 参数，因此它将它传递给您的函数导致错误。您可能会对mcmapply 感到困惑，它确实需要SIMPLIFY 参数。