让 Rscript 读取或从标准输入获取输入答案

【问题标题】：Have an Rscript read or take input from stdin让 Rscript 读取或从标准输入获取输入
【发布时间】：2014-04-01 20:41:14
【问题描述】：

当给定文件名作为参数时，我看到了如何让 Rscript 执行我想要的操作，例如如果我的 Rscript 被称为 script 并包含：

#!/usr/bin/Rscript 
path <- commandArgs()[1]
writeLines(readLines(path))

然后我可以从 bash 命令行运行：

Rscript script filename.Rmd --args dev='svg'

并成功地将filename.Rmd 的内容回显给我。如果不是将上述参数传递给filename.Rmd 之类的文件名，而是想从stdin 传递文本，我尝试修改我的脚本以从标准输入读取：

#!/usr/bin/Rscript 
writeLines(file("stdin"))

但我不知道如何为这种情况构建命令行调用。我尝试在内容中添加管道：

cat filename.Rmd | Rscript script --args dev='svg'

还尝试了重定向：

Rscript script --args dev='svg' < filename.Rmd

无论哪种方式我都会收到错误：

Error in writeLines(file("stdin")) : invalid 'text' argument

（我也试过open(file("stdin"))）。我不确定我是在错误地构建 Rscript，还是错误地构建了命令行参数，或者两者兼而有之。

【问题讨论】：

标签： r bash stdin

【解决方案1】：

您需要从file("stdin") 创建的连接中读取文本，以便将任何有用的信息传递给writeLines() 的text 参数。这应该工作

#!/usr/bin/Rscript 
writeLines(readLines(file("stdin")))

【讨论】：