用于交换数据（例如 PDF 值）的 Java/R 接口 (JRI) 代码答案

【问题标题】：Java/R Interface (JRI) code for exchanging data (e.g., PDF values)用于交换数据（例如 PDF 值）的 Java/R 接口 (JRI) 代码
【发布时间】：2012-03-05 03:56:17
【问题描述】：

是否可以在 R 中使用 Java 程序的输入进行一些简单的计算，并将响应输入到该 Java 程序中？

Java 和 R 之间的这种数据交换的一个典型示例是计算数字数组（例如 Java double[] 数组）的概率分布函数 (PDF)。

在 Java 类中，数组应该通过 Java/R 接口 (JRI) 传递给 R，并且计算的结果不应该是图形（就像 JRI 在 JFrame 中所做的那样），而是另一个数组可以从同一个 Java 类中检索到的值（或类似的 Java 数据结构）以供进一步处理。

JRI 分配部分如下所示：

Rengine re=new Rengine(new String [] {"--vanilla"}, false, null);

if (!re.waitForR())
{
    System.out.println ("Cannot load R");
    return;
}

double[] values = ... // The data values

re.assign("data", values);

因此，问题是上面的data 数组是否可以在 R 中处理，如已经描述的那样（例如，对于 PDF），结果返回给调用 Java 类，而不是由 R 以图形方式绘制。

这可能吗？如果可以，是否有任何示例代码演示它？

【问题讨论】：

标签： java r jri

【解决方案1】：

我能看到的最简单的实现方法是让 Java 使用 this simple method 或 these more careful methods 之类的方法运行 R。 R 会将输出发送到标准输出，标准输出可以在 Java 中提取和解析。

查看 R 中的 ?Rscript 以查看从 Java 运行的系统调用的格式。

一种更强大的方法（我使用过的一种）通过使用 Java（或您正在使用的任何其他程序）将 R 命令和数据保存到一个或多个文本文件（可能是一个 script.R 和一个或更多 data1.tab 文件），在 R 脚本文件中调用 R 读取，在 R 中将结果保存到文本文件，然后让 Java（或其他）读取结果并进行清理。当然，这里的缺点是速度。如果你可以让内联方法（stdin/stdout）为你工作，它会快很多。

虽然这并没有将您指向 JRI，但在 Java（或其他）中编写一些为任意 R 代码和一组自动生成的 Java 向量/矩阵提供此类接口的函数将非常容易使用为 R 函数 ?dump 指定的格式在脚本中传递给 R。

【讨论】：