【发布时间】：2020-04-29 17:24:44
【问题描述】：
在flask-restplus 中，我正在尝试使用Python 中的参数调用R 函数，其中参数来自POST 请求JSON 正文。为此，首先我在 python 中加载 R 函数并将 json 数据作为参数传递，但最终出现以下错误：
TypeError: 'ListVector' object is not callable
我不明白为什么，我从rpy2 文档中没有找到太多关于函数调用的信息。有没有办法将参数传递给 R 函数并在 python 中调用该函数？谁能指出我任何可能的方法来做到这一点？有什么想法吗？
我目前尝试使用最少 api 的代码
输入json数据：
{
"body": {
"sex": "M",
"feat_aa": {
"value": 12,
"machine": "AC"
},
"feat_bb": {
"value": 13,
"machine": "AB"
}
}
}
玩具R功能：
library(jsonlite)
my_func <- function(json_data){
qry=fromJSON(json_data)
data=qry$body
## do something
}
这里是最小烧瓶 api 的主要代码：
from flask import Flask, jsonify, request
from flask_restplus import Api, Namespace, Resource, fields
import rpy2
import rpy2.robjects as robjects
##
app = Flask(__name__)
api = Api(app)
ns = Namespace('hello')
features_attr = api.model('hello_world', {
'value': fields.Integer(required=True),
'machine': fields.String(required=True)
})
feat_root_objs = api.model('my machine', {
'sex': fields.String(required=True),
'features': fields.List(fields.Nested(features_attr, required=True))
})
@ns.route('/hello')
class helloWorld(Resource):
@ns.expect(feat_root_objs, validate=False)
def post(self):
myfunc = robjects.r.source("my_func.R")
param = request.get_json()
res = myfunc(['param'])
# res = myfunc(param)
return jsonify(res)
if __name__ == '__main__':
api.add_namespace(ns)
app.run(debug=True)
如何将参数/参数传递给 R 函数并从 python 调用函数？有什么想法可以做到这一点吗？谢谢
更新
我也尝试过这个尝试：
def post(self):
myfunc = robjects.r.source("my_func.R")
param = request.get_json()
res = myfunc(param)
return jsonify({"output": res})
但我总是有以下错误：
> [2020-04-29 12:47:02,104] ERROR in app: Exception on
> /Ed_features/match_ed [POST] Traceback (most recent call last): File
> "C:\Users\jyson\AppData\Local\Programs\Python\Python37\Lib\site-packages\flask\app.py",
> line 1832, in full_dispatch_request
> rv = self.dispatch_request() File "C:\Users\jyson\AppData\Local\Programs\Python\Python37\Lib\site-packages\flask\app.py",
> line 1818, in dispatch_request
> return self.view_functions[rule.endpoint](**req.view_args) File "C:\Users\jyson\AppData\Local\Programs\Python\Python37\Lib\site-packages\flask_restplus\api.py",
> line 309, in wrapper
> resp = resource(*args, **kwargs) File "C:\Users\jyson\AppData\Local\Programs\Python\Python37\Lib\site-packages\flask\views.py",
> line 88, in view
> return self.dispatch_request(*args, **kwargs) File "C:\Users\jyson\AppData\Local\Programs\Python\Python37\Lib\site-packages\flask_restplus\resource.py",
> line 44, in dispatch_request
> resp = meth(*args, **kwargs) File "C:\Users\jyson\match_api\imm_server\heylo_ed.py", line 58, in post
> res = myfunc(param) TypeError: 'ListVector' object is not callable
【问题讨论】：
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调用
myfunc(['param'])传递一个包含字符串param的列表。你试过myfunc(param)。此外，由于您只发布了回溯的最后一行，因此其他人很难判断您的代码的哪一部分产生了异常。 -
@v25 是的，我试过了，但我得到了这个错误：
TypeError: 'ListVector' object is not callable。我对这个问题感到绝望。您的帮助将不胜感激。 -
@v25 我粘贴了 python 抛出的异常列表。如何解决这个问题？你有想法吗？谢谢
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很抱歉，我帮不上忙。不过，我设法在more minimal example 中重新创建了它。我怀疑这个问题与 R 函数有关，而不是与 python 代码有关。随意使用它来重新发布/编辑。把烧瓶相关的东西拿出来可能会更好。
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@v25 如何将参数传递给 r 函数？这样做的正确方法是什么？请问有什么想法吗？