在 R 中，使用带有命令行参数的空格在路径中调用外部程序

Question

这里有一系列令人沮丧的问题。 本质上，我希望 R 使用命令行参数打开一个外部程序。我目前正在尝试在 Windows 机器上实现它，理想情况下它可以跨平台工作。

程序 (chimera.exe) 位于包含空格的目录中：C:\Program Files\Chimera1.15\bin\ 例如，命令行选项可以是 --nogui 标志和脚本名称，所以我会从 shell 编写（除了空间细节）：

C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe --nogui scriptfile

如果我在 windows cmd.exe 中进入目录本身并输入 chimera.exe --nogui scriptfile，则此方法有效

现在在 R 中：

我一直在玩 shell()、shell.exec() 和 system()，但基本上我因为空格和/或路径分隔符而失败了。

大多数时候 system() 出于某种原因只打印“127”：

> system("C:/Program Files/Chimera1.15/bin/chimera.exe")
[1] 127`

后/正斜线使问题进一步复杂化，但不能使其发挥作用：

> system("C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe")
Error: '\P' is an unrecognized escape in character string starting "C\P"

> system("C:\\Program Files\\Chimera1.15\\bin\\chimera.exe")
[1] 127

> system("C:\\Program\ Files\\Chimera1.15\\bin\\chimera.exe")
[1] 127

> system("C:\\Program\\ Files\\Chimera1.15\\bin\\chimera.exe")
[1] 127

当我将程序安装在没有空格的目录中时，它可以工作。如何在system() 或相关命令中转义或传递空格，或者如何调用程序？

Answer 1

尝试system2，因为它不使用cmd 行处理器并使用r"{...}" 以避免必须使用双反斜杠。这假设 R 4.0 或更高版本。有关引号语法的完整定义，请参阅 ?Quotes。

chimera <- r"{C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe}"
system2(chimera, c("--nogui",  "myscript"))

例如，这对我有用（您可能需要更改路径）：

R <- r"{C:\Program Files\R\R-4.1\bin\x64\Rgui.exe}"  # modify as needed
system2(R, c("abc", "def"))

当 Rgui 启动时，我们可以通过在 R 的新实例中运行它来验证参数是否已传递：

commandArgs()
## [1] "C:\\PROGRA~1\\R\\R-4.1\\bin\\x64\\Rgui.exe"
## [2] "abc"                                       
## [3] "def"   

系统

交替使用system，但在路径周围加上引号，以便cmd 正确解释它——如果它被输入到Windows cmd 行中，也需要引号。

system(r"{"C:\Program Files\Chimera1.15\bin\chimera.exe" --nogui myscript}")