我在 R 2.14 的更改中注意到了这一点：
R CMD Sweave 现在有一个 --pdf 选项来生成处理过的 Sweave 文档的 PDF 版本。
尝试一下，我注意到它不仅在生成的 tex 上运行了 pdfLaTeX，而且还正确地包含了 bibTeX 引用并在之后进行了清理。现在似乎是使用 Sweave 的一种非常非常好的方式（更不用说现在在编辑器中实现整个例程是多么容易）。
但是现在运行的到底是什么？我找不到更多关于它的细节。似乎 Sweave -> pdflatex -> bibtex -> pdflatex -> pdflatex 至少？
【问题讨论】：
感谢您的提问。我一直想知道这个“自动”过程背后的代码。
R CMD Sweave --pdf 最终调用tools::texi2dvi，其中：
运行 [s] latex 和 bibtex 直到所有交叉引用都得到解决并且 创建[s] dvi 或 PDF 文件。
(See here for more texi2dvi details).
这是由R CMD Sweave --pdf 调用启动的事件链：
源文件rcmdfn.c 的代码指示R CMD Sweave 运行utils:::.Sweave() --args" 到Rterm.exe。
如果设置了--pdf，则utils:::.Sweave() 调用tools::texi2pdf() 来处理Sweave 文件。
texi2pdf() 依次调用tools::texi2dvi()。
最后，texi2dvi() 查看环境以了解可用的工具，并执行上面链接的帮助文件中描述的工作。
【讨论】：
您可以尝试手动执行从 Rnw 到 pdf 的转换，然后查看各个步骤需要多少次才能获得与 R CMD Sweave 相同的结果。
【讨论】：
我不太了解内部工作原理，但我知道 RStudio 的开发版本会让您在knitr 和Sweave 之间以及pdflatex 和xelatex 之间进行选择，并给出@987654325 @ 作为一个选项。
【讨论】：