Knitr：opts_chunk$set() 在 Rscript 命令中不起作用

Question

我正在使用 knitr 从 Rmd 创建一个降价文件，我在 .Rmd 脚本的顶部设置了以下选项来隐藏所有结果和绘图：

```{r, echo=FALSE}
opts_chunk$set(results="hide", fig.show="hide")
```

当我在 RStudio 中点击 Knit HTML 按钮时，这很有效 - 我得到了没有结果和数字的输出。但是如果我从命令行运行：

Rscript -e 'knitr::knit("myfile.Rmd")'

看来opts_chunk$set() 行没有被读取，我在.md 输出中得到了结果和绘图。我通过在 Rscript 命令中指定这些选项解决了这个问题：

Rscript -e 'library(knitr); opts_chunk$set(results="hide", fig.show="hide"); knit("myfile.Rmd")'

但我宁愿保留从我正在使用的文件中读取的所有选项，而不是在命令行中指定。当knit在命令行使用 Rscript 时，如何在 .Rmd 文件中读取选项？

谢谢。

Answer 1

我认为你需要添加

library("knitr")

到块（您可能想在该块的块选项中设置message=FALSE）。

问题是当你这样做时

Rscript -e 'knitr::knit("myfile.Rmd")'

您实际上并未附加 knitr 包，这意味着它不在函数的搜索路径中，这意味着 R 找不到 opts_chunk 对象。

• 使用knitr::opts_chunk 也可能有用...
• 正如你所建议的，Rscript -e 'library("knitr"); knit("myfile.Rmd")' 也是如此

当您在 RStudio 中单击按钮时，RStudio 会自动在运行 knit() 的环境中加载 knitr。