rJava：如何获取堆栈跟踪/更详细的错误？答案

【问题标题】：rJava: How to get stack traces / more verbose error?rJava：如何获取堆栈跟踪/更详细的错误？
【发布时间】：2015-12-07 11:15:26
【问题描述】：

有没有办法让 rJava 打印出错误的完整堆栈跟踪，而不仅仅是异常？例如，这段代码（尝试从 R 调用 Ambit2 化学信息学库）

smrkMan <- .jnew("ambit2.smarts.SMIRKSManager", dcob)
reaction <- .jcall(smrkMan, "Lambit2/smarts/SMIRKSReaction;", "parse", ">>C" )
res <-  .jcall(smrkMan, "Z", "applyTransformation", AC, 
             .jnull("ambit2/smarts/IAcceptable"),
             reaction)

只给我

Fehler in .jcall(smrkMan, "Z", "applyTransformation", AC,
.jnull("ambit2/smarts/IAcceptable"),  : 
java.lang.NullPointerException

这不是非常有用，我想看看它在哪一行失败，以便我可以返回并在源代码中跟踪它......

有没有可能？

【问题讨论】：

标签： java r rjava

【解决方案1】：

您可以使用.jgetEx() 获取异常对象并打印堆栈跟踪：

> .jcall("C",,"main",check=FALSE)
> ex=.jgetEx()
> .jcheck()
Error: java.lang.Exception: foo
> ex$printStackTrace()
java.lang.Exception: foo
    at C.main(C.java:3)

与

public class C {
  static void main() throws Exception {
  throw new Exception("foo"); } }

请确保在调用printStackTrace() 之前调用.jclear() 或.jcheck()，因为在您清除异常之前Java 不会执行任何操作。

【讨论】：