在 WSL 上安装 R devtools 包

Question

问题：

我正在尝试为 R 安装 devtools 软件包。我在 WSL（Linux 的 Windows 子系统）上使用 Ubuntu 18.04 LTS。

我可以通过在 WSL 上的 R 中简单地调用 install.packages() 来安装一些软件包。但是，其他包似乎给我带来了麻烦。

我尝试过的以下方法似乎都不起作用：
* 我尝试使用install.packages() 安装软件包。
* 我尝试从源代码安装到/usr/local/lib/R/site-library。
* 我尝试从源代码安装到个人库中。

错误信息：

我收到了与here 讨论的类似的错误消息，但我无法通过编辑unpackPkgZip 来解决问题，因为它不存在。

问题：

如何在 WSL 上安装 devtools？

Answer 1

解决方案：

我能够通过重新开始来解决问题。我卸载了 Ubuntu，然后重新安装了它。全新安装 Ubuntu 18.04 我遵循了这些instructions。还有其他在线教程可能工作得很好，但我遵循了这个。如果你愿意，你可以忽略关于安装 rstudio 服务器和 fsl 包的部分。

# Install R on WSL
sudo apt-get update -qq -y
sudo apt-get install -y wget git
OS_DISTRIBUTION=$(lsb_release -cs)
wget -O- http://neuro.debian.net/lists/${OS_DISTRIBUTION}.us-nh.full | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pool.sks-keyservers.net:80 0xA5D32F012649A5A9
sudo apt-get update

sudo apt-get install libopenblas-base r-base
sudo apt-get update -qq -y
sudo apt-get install -y libgit2-dev 
sudo apt-get install -y libcurl4-openssl-dev libssl-dev
sudo apt-get install -y zlib1g-dev libssh2-1-dev libpq-dev libxml2-dev 
#sudo apt-get install -y libhdf5 # This didn't work.

现在尝试在 R 中安装 devtools。

# Install devtools
install.packages("devtools", repos = "https://cran.rstudio.com/")

权限错误：

如果遇到如下的权限错误...

install.packages("edgeR") 中的警告：'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable 您想改用个人库吗？ （是/否）

...您需要为用户提供对安装 R 包的目录的写入权限（请参阅here）。尝试更改此目录的组所有权：

# Who has ownership of /usr/local/lib/R/site-library/?
ls -l /usr/local/lib/R/
# drwxrwsr-x 1 root staff 512 Jul 18 21:38 site-library

# Change ownership.
sudo chgrp twesleyb /usr/local/lib/R/site-library/
ls -l /usr/local/lib/R/
#drwxrwxr-x 1 root twesleyb 512 Jul 18 21:38 site-library

# In this case I have write access, but in case you need to add it, try:
# $ sudo chmod g+w /usr/local/lib/R/site-library

你现在应该可以install.packages("package")了。

我是 linux 新手，但我认为这是一件好事。

更新：

您也可以尝试关注duckmayr的instructions。