rJava 安装在 macOS 10.14 上失败

Question

升级到 MacOS Mojave (10.14.1) 后，我无法再为安装了 Java 版本“1.8.0_102”的 R 版本 3.5.1 安装 rJava。

我尝试了previous solution for MacOS 10.11，但它仍然不起作用，出现此错误：

Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
 call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
 error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
 dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib
 Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
 Reason: image not found

Answer 1

发布我找到的解决方案以防它对其他人有所帮助 - 我不太明白为什么会这样，或者它是否是正确的方法，所以寻找更好的替代方案！

这个issue 导致this Apple forum 声明的地方

对于在 /usr/include 下的基本系统中查找 macOS 标头的旧版软件，请安装位于以下位置的包文件：/Library/Developer/CommandLineTools/Packages/macOS_SDK_headers_for_macOS_10.14。包

为此，打开终端并运行这些命令

cd /Library/Developer/CommandLineTools/Packages/
open macOS_SDK_headers_for_macOS_10.14.pkg

然后按照提示安装软件包。

在此之后，在终端中，配置 rJava 并按照上一个答案进行安装

sudo R CMD javareconf

R -e "install.packages('rJava')"

它应该可以毫无问题地安装。

Answer 2

安装 JDK 11.04 LTS 后，我在 Mojave 上的 R Studio 中遇到了同样的错误

R 期待 Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk

尽管运行sudo R CMD javareconf，错误仍然存​​在

因此我在finder中浏览到/Library/Java/JavaVirtualMachines/并将文件夹"jdk-11.0.4.jdk"重命名为"jdk-11.0.1.jdk"

重新启动 R，library(rJava) 和 library(xlsx) 现在都可以工作了。

希望这对某人有所帮助

Answer 3

我遇到了确切的问题。我通过以下方式解决了它：

1. 安装latest version of Java（dmg 文件）

2. 在 Studio 中安装 rJava：install.packages("rJava")

3. 在终端：sudo mv jdk-12.0.1.jdk jdk-11.0.1.jdk

否则Rstudio会出现如下错误：

Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
  Reason: image not found

4. 在工作室：library(rJava)

5. rJava 应该已经加载没有问题。

Answer 4

当我尝试在我的 macOS（Mojave 版本）中安装“rJava”时遇到了同样的问题。

我执行以下步骤来解决问题。

R 版本：3.6.1

问题：配置：错误：缺少一个或多个 Java 工具。 *** JDK 不完整！请确保您拥有完整的 JDK。 JRE 不够足够。

解决方案：在终端中执行以下命令

1. $ /usr/libexec/java_home -V

    Matching Java Virtual Machines (1):
        1.8.0_162, x86_64:  "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_221.jdk(your Java version)/Contents/Home

1. $ export JAVA_HOME=/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_221.jdk/Contents/Home

2. $ export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH

3. $ R CMD javareconf

4. $ R --quiet -e 'install.packages("rJava", type="source", repos="http://cran.us.r-project.org")'