你如何在 ubuntu 上运行 R 文件？

Question

我尝试使用以下代码从服务器上的 ubuntu 终端运行 Rscript 文件：

Rscript etl/ConceptTables/loadTables.R mimiciii"

该文件位于下面的指定目录中，但我需要从根目录运行脚本。但是，它说这个文件不存在，但它显然存在。我也尝试通过先进入 R 环境来运行它，但我得到了：

"Error: Unexpected symbol in "etl/ConceptTables/loadTables.R mimiciii"

我在 github 上遵循这个模仿 Omoop ETL 的说明：https://github.com/chichukw/mimic-omop/blob/master/README-run-etl.md 并且我已经使用我的用户名和数据库名称创建了 cpg 文件。谁能澄清我做错了什么？

Answer 1

尝试使用文件的完整路径。您发布的错误是“意外符号”

可能是因为您在 mimiiiiii 的末尾添加了双引号。还是发布问题时出错？

如果您使用双引号作为路径，请确保它是“而不是”。