gnuplot5 - sh：1：语法错误：“（”意外与awk

Question

我正在尝试在 gnuplot 中将 paste 与 awk 结合使用，以便我可以获取两个不同文件的某些列并绘制结果。但是，我收到此错误：

sh: 1: Syntax error: "(" unexpected

我知道它对我的 gnuplot 脚本的那部分不满意：

system("paste <(awk '{print $1,$2,$3,$4,$5,$14}' ".filename(i).") <(awk '{print $14}' ".filename_without.")  > Tim_res_".i)

更具体地说是 awk 之前的括号。在不使用变量名的情况下替换文件名也不起作用，而所有命令在 gnuplot 之外都可以正常工作。如果我删除括号，那么它会说它无法识别 awk，并且该命令在 gnuplot 之外也不起作用。

我读过添加#!/usr/bin/bash 可能会有所帮助，但它实际上并不能解决问题，也不会给出另一个错误消息。我以前从未在 gnuplot 中使用此类命令遇到过此类问题。 我有很多文件要以类似的方式绘制，因此为什么我想直接在 gnuplot 中使其自动运行，system 命令只是在这里确保它在我可以直接在@987654326 之后替换它之前工作@gnuplot 的命令。

感谢您的帮助

Answer 1

mklement0 has explained 问题所在 - 一种解决方法是完全避免进程替换：

awk 'NR == FNR { col[NR] = $14; next } { print $1,$2,$3,$4,$5,$14,col[FNR] }' file2 file1

即先读取第二个文件并保存列，然后在awk中自己“粘贴”。

将 awk 命令移至 gnuplot：

system("awk 'NR == FNR { col[NR] = $14; next } \
{ print $1,$2,$3,$4,$5,$14,col[FNR] }' " . filename_without . " " . filename(i))

Answer 2

如错误消息所示，您的命令是使用 sh (/bin/sh) 执行的，这是 gnuplot 的 system 命令所使用的。

sh，只能假定具有 POSIX 强制功能，不支持 process substitutions (<(...))，这是非标准 Bash 功能。 p>

Tom Fenech's helpful answer 显示了您的命令的重新表述，完全绕过了进程替换的需要。

如果您确实需要（相当于）流程替换：

• (a) 要么：调用bash -c 作为system() 命令字符串的一部分，并将原始命令传递给它（这会带来引用挑战）。

• (b) 或者：使用临时文件而不是进程替换；在您的情况下，创建至少 1 个包含 awk 输出的临时文件，然后将其传递给 paste。

简化示例：

(a) 使用嵌入式bash -c 调用：

system("bash -c \"paste <(cat '".filename1."') <(cat '".filename2."')\"")

注意内部命令是如何包含在\" 中的，因此它可以作为单个参数传递给bash -c。

(b) 使用临时文件：

system("cat '".filename1."'>>/tmp/$$; cat '".filename2."' | paste /tmp/$$ -; rm /tmp/$$")

注意 1 个awk 命令如何通过管道向paste 提供输入，但另一个需要一个临时文件。