【发布时间】：2020-08-30 06:28:44
【问题描述】：
我正在制作一个闪亮的 R 应用程序，它使用 DBI 和 odbc 调用数据库（SQL Server）并显示一个表。我的应用程序在我的本地机器上完美运行。但是，当我尝试将闪亮的应用程序 dockerize 时，它只是无法启动。不知道为什么这不起作用。
我觉得我可能需要在我的 dockerfile 中安装 odbc 驱动器。也许我还缺少其他东西......
我是 docker 新手。如果有人可以展示我如何修改我的 dockerfile 以便我的闪亮应用程序也可以用作 docker 容器，我将不胜感激。
下面是我的dockerfile：
# Base image https://hub.docker.com/u/rocker/
FROM rocker/shiny:latest
# system libraries of general use
RUN apt-get update -qq && apt-get -y --no-install-recommends install \
libxml2-dev \
libcairo2-dev \
libsqlite3-dev \
libmariadbd-dev \
libpq-dev \
libssh2-1-dev \
unixodbc-dev \
libcurl4-openssl-dev \
libssl-dev
## update system libraries
RUN apt-get update && \
apt-get upgrade -y && \
apt-get clean
# Install R packages that are required
RUN R -e "install.packages(c('dplyr','DT', 'DBI', 'odbc'), repos='http://cran.rstudio.com/')"
# Copy configuration files into the Docker image
COPY shiny-server.conf /etc/shiny-server/shiny-server.conf
COPY /app /srv/shiny-server/
# Make the ShinyApp available at port 80
EXPOSE 80
# Copy further configuration files into the Docker image
COPY shiny-server.sh /usr/bin/shiny-server.sh
CMD ["/usr/bin/shiny-server.sh"]
下面是我闪亮的 ui.r：
ui <- fluidPage(
titlePanel("Database table"),
sidebarLayout(
sidebarPanel(),
mainPanel(
fluidRow (
column(12, DT::dataTableOutput('datatable')) )
)
)
)
我的服务器.r
server <- function(input, output, session) {
conn <- DBI::dbConnect(odbc::odbc(),
Driver = "ODBC Driver 17 for SQL Server",
Server = 'xxxxxx',
Database = "xxxxxx",
UID = "xxxxxx",
PWD = 'xxxxxxx',
port=1433)
df = dbGetQuery(conn, "SELECT * FROM myTable")
dbDisconnect(conn)
output$datatable <- DT::renderDataTable({
DT::datatable(df)
})
}
global.r：
library(shiny)
library(DBI)
library(odbc)
library(dplyr)
library(DT)
【问题讨论】：
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我认为我们遗漏了一部分，您是在运行 SQL Server 容器，还是 R 容器应该与主机上的 SQL Server 通信？另外：“但是，当我尝试将闪亮的应用程序 docker 化时，它只是无法启动。” - 我们可以看到失败的截图吗？如果您尝试从容器中手动运行 R 程序会发生什么？应用程序不工作还是 docker 无法启动？我敢打赌问题是数据库连接，但仅基于该描述很难确定。可能值得在 R 脚本中添加错误处理。让我们知道您的进展情况
标签： r docker shiny dockerfile odbc