编译 Rpackage 的问题：使用 Rcpp 的 asNamespace(ns) 中的错误

Question

在一个小的 Rcpp 包上工作以使用 Boost 及其在 C 中的一些几何函数。

完成了函数的编写，一切正常。在推送到 GitHub 之前，最后一次测试一切正常（Clean and Rebuild 并测试功能）。一旦我仔细检查了目录是否全部干净地存储在 GitHub 中，我就从本地计算机中删除了该目录。还应该注意的是，我在上面运行了 Roxygen2 并管理 NAMESPACE 文件。

在将目录克隆回来并Clean and Rebuild 时，我收到以下错误：

==> Rcpp::compileAttributes()

* Updated R/RcppExports.R

==> R CMD INSTALL --preclean --no-multiarch --with-keep.source MinimumRcpp

* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library’
* installing *source* package ‘MinimumRcpp’ ...
clang++ -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG  -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2 -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
** libs
clang++ -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG  -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2 -c findParetoSet.cpp -o findParetoSet.o
clang++ -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG  -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2 -c kintersection.cpp -o kintersection.o
clang++ -std=gnu++11 -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o MinimumRcpp.so RcppExports.o findParetoSet.o kintersection.o -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation
installing to /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/MinimumRcpp/libs
** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Error in asNamespace(ns) : not a namespace
Error : unable to load R code in package ‘MinimumRcpp’
ERROR: lazy loading failed for package ‘MinimumRcpp’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/MinimumRcpp’

Exited with status 1.

当然，代码没有任何变化。但是，我确实有以下 .gitignore 文件：

# /.gitignore
inst/lib
.Rproj.user     ## Could this be an issue? 
.Rproj.user/    ## Could this be an issue? 
.Rproj.user/**  ## Could this be an issue? 
src/*.o
src/*.so
src/*.dll
src/symbols.rds
.Rhistory
.RData
.DS_Store

## QtCreator
Rcpp.pro
Rcpp.pro.user
*.autosave
.#*

*.tar.gz

vignettes/*_cache

## GNU global
GPATH
GRTAGS
GTAGS

##
local/

## docker helpers
docker/*sh
docker/*/*.sh

# /.Rbuildignore
debian
inst/doc/html
inst/doc/latex
inst/doc/man
inst/doc/jss.bst
vignettes/jss.bst
^.*\.Rproj$
^\.Rproj\.user$
vignettes/notyet
doxyfile
\.travis\.yml
\.dir-locals\.el
\.clang_format
vignettes/getCurrentVersionsOfCitedPackages.R
^Contributing.md$
^\.codecov\.yml$
inst/include/Rcpp.h.new
inst/include/Rcpp.h.old
LICENSE
.*\.tar\.gz$
\.editorconfig
docker
^GPATH
^GRTAGS
^GTAGS
^local
vignettes/Makefile
vignettes/rmd
\.github

是否有可能一些构建软件包所需的软件包数据被遗留下来并导致当前问题？

我们将不胜感激。此外，任何关于如何调试的建议都会有所帮助，因为当前的输出消息非常模糊，让我无所适从。

这里是可重复性的 GitHub 存储库：https://github.com/eduardoRubioG/MinimumRcpp

Answer 1

菜鸟错误，但很严重：

• 永远永远将脚本文件保存在您的R/ 目录中

• 目录中的所有内容（我们的意思是所有内容）都得到了来源（假设它看起来像 R 代码，_即以 .R 结尾）

• 你留下了一个带有library(MinimumRcpp)调用的脚本，所以现在你的包字节码编译想要自己获取源 --> 不是一个好计划

• 简而言之，保留此类脚本，但将它们放在 例如 local/ 并通过 .Rbuildignore 排除 local/。

还有一堂重要的风格课

• 不要在代码中留下rm(list = ls(all = TRUE))

因此，如果您执行mv R/script.R R/script.R.txt 并重建，一切都会好起来的。

（我收到了六条警告，因为 n 不是 size_t，而是与一个相比。您可能想早点施放它。）