使用混合（）时选择 lmerTest 和未定义列的计算错误答案

【问题标题】：Computational error with lmerTest and undefined columns selected when using mixed()使用混合（）时选择 lmerTest 和未定义列的计算错误
【发布时间】：2017-10-01 00:37:26
【问题描述】：

我想拟合混合效应线性回归。因变量是 4 点评级量表上的可接受性判断（完全不可接受到完全不可接受）。这些判断被分配了一个数值（1、2、3、4），并且该向量被居中和缩放。

我用以下代码调用模型：

ln1 = lmer(RatingNorm ~ Group + ProfScore + RegularityInflectedForm + RegRhyme*SimilarityReal + Tense + VerbClass + (1|SubjectID) + (1|Infinitive), data=AJT1)

然后尝试 p 值：

混合（ln1，AJT1）

拟合模型后未出现错误消息。使用 afex 包中的 mixed() 来获取 p 值会给出一个奇怪的错误消息。

Fitting one lmer() model. [DONE]
Calculating p-values. 
anova from lme4 is returned
some computational error has occurred in lmerTest
Error in `[.data.frame`(anova_table, , c("NumDF", "DenDF", "F.value",  : 
  undefined columns selected

当我使用 lmerTest 包调用相同的模型时，这种情况会重复出现。我还尝试了仅具有一种固定效果的更简单模型（仅使用 Group 或仅 Tense，它们是分类的，以及仅使用 ProfScore，它是连续的），以及仅使用两种随机效果中的一种。同样的错误总是重复。但是，我可以使用 anova(model) 查看 p 值。我想知道为什么在这种情况下我不能成功使用混合（）。我还安装了最新版本的 R，但没有看到任何帖子显示这种情况下的类似错误。

这里是代码和数据集的链接：

【问题讨论】：

标签： r mixed-models

【解决方案1】：

我在尝试在 R 中使用分段SEM 时遇到了类似的问题。如果我消除了 DVpopStand 模型的混合模型部分（并使用 lm），它运行良好。

垃圾箱 = 列表（

lmer(DVpopStand ~ Treatment + Site + (1|fLine/fBowl)),

lmer(centroidStand ~ Treatment + Site+ (1|fLine/fBowl)),

lmer(Crush ~ Treatment + Site + centroidStand + DVpopStand + (1|fLine/fBowl)) )

Model.result = sem.fit(dumpster, data= F1culled)

并得到错误信息：

返回来自 lme4 的摘要

lmerTest 中发生了一些计算错误

[.data.frame(ret, 3:4) 中的错误：选择了未定义的列

【讨论】：