如何更改 CCA 图中样本的标签答案

【问题标题】：How to change the labels of samples in CCA plot如何更改 CCA 图中样本的标签
【发布时间】：2015-07-07 13:38:55
【问题描述】：

通过使用vegan 包，我绘制了CCA 图。我已将envi 文件中的第一列添加为样本名称。但是，图中的样本被标记为默认值，例如row1,row2,....。我想将样品标签更改为我的表格中列出的特定标签，例如Jan.S1,Jan.S2,.....。我应该如何更改标签？另外，如何改变这些标签的位置以避免与点重叠？

在这里，我附上我的代码如下：

speciesdata=read.csv("species.csv", header=T, sep=",") 
envdata= read.csv("envi.csv", header=T, sep=",")
Miseq.cca=cca(speciesdata ~ TN + TP + NH4  + pH + Zn + Pb + Cd + Ni + Cr, data = envdata)
Miseq.cca
plot(Miseq.cca,display=c("si","bp"),scaling=3)

【问题讨论】：

标签： r

【解决方案1】：

您可以使用参数row.names=1。这将使 R 假定 csv 表的第一列是样本名称，而不是数据。

例如： 1) 将“Jan.S1, Jan.S2,.....”放在您的 species.csv 文件的第一列。

2) 在 R 脚本上使用speciesdata=read.csv("species.csv", header=T, sep=",",row.names=1)。

【讨论】：