从 r 中的第二个数据帧中过滤 r 行名称中的数据帧

Question

我有 data.frame ：

df1<-data.frame("Sp1"=1:6,"Sp2"=7:12,"Sp3"=13:18)
rownames(df1)=c("A","B","C","D","E","F")

df1

  Sp1 Sp2 Sp3
A   1   7  13
B   2   8  14
C   3   9  15
D   4  10  16
E   5  11  17
F   6  12  18

我通过 rowSums(df1) 的截止值过滤 df1 并返回我想包含在下游分析中的站点（行名）。

include<-rownames(df1[rowSums(df1)>=22,])
include

[1] "B" "C" "D" "E" "F"

我有第二个 data.frame ：

df2<-data.frame(site.x=c("A","B","C"), site.y=c("D","E","F"),score=1:3)

  site.x site.y score
1      A      D     1
2      B      E     2
3      C      F     3

我想过滤 df2 使其仅包含 df2$site.x 和 df2$site.y 与“包含”中列出的站点完全相同的行，即过滤掉包含“A”的行并返回。

  site.x site.y score    
2      B      E     2
3      C      F     3

我试过了：

filter<-df2$site.x == include & df2$site.y == include   

filtered<-df2[filter,]

感谢您的建议！

回答

使用 %in%

filter<-df2$site.x %in% include & df2$site.y =%in% include  

filtered<-df2[filter,]
filtered

   site.x site.y score
 2      B      E     2
 3      C      F     3

Answer 1

对我来说，它适用于：

filter<-df2$site.x %in% include & df2$site.y %in% include
df2[filter,]

事实上，您在问题的最后两行中输入了df1 而不是df2。