在 .Rprofile 中加载 tidyverse 时出现 tidyverse 问题答案

【问题标题】：tidyverse problems when loading tidyverse in .Rprofile在 .Rprofile 中加载 tidyverse 时出现 tidyverse 问题
【发布时间】：2019-01-28 15:04:03
【问题描述】：

我最近尝试使用 .Rprofile 文件。在我的项目中，我总是使用 tidyverse 包，所以我想我会在项目的主目录中创建一个 .Rprofile 文件来加载库：

library(tidyverse)

当我打开项目时确实加载了库，但我没有像往常一样运行。

此代码给出错误：

tibble(a = 1:5) %>% filter(a > 4)

过滤器错误（., a > 4）：找不到对象“a”

我假设我必须在 .Rprofile 中包含一些内容，但我找不到它是什么。

【问题讨论】：

请检查加载的包，因为我无法重现该问题
在 .Rprofile 中加载包几乎总是一个坏主意，因为这会将您的软件与您的特定配置联系起来。
你需要在tidyverse之前加载默认包。使用您的解决方案，您之前加载了tidyverse，因此filter 函数（如果未指定）来自stats 包。即使非常难看，在.Rprofile 中的library(tidyverse) 之前插入invisible(lapply(.Options$defaultPackages, function(x) library(x, character.only=TRUE)))。
我还想强调@G.Grothendieck 所说的：不要在您的个人资料中加载包。这是一种非常糟糕的做法，并且会降低您的代码的可移植性。
谢谢，您的解决方案运行良好。我还找到了options(defaultPackages=c(getOption("defaultPackages"), "tidyverse"))。但是，我会听取您的建议，而不是在 .Rprofile 中批量打包。

标签： r tidyverse

【解决方案1】：

您是否尝试过使用dplyr::filter？ R中默认有一个过滤器功能，所以你需要指定它是dplyr的过滤器。试试tibble(a = 1:5) %>% dplyr::filter(a > 4)

【讨论】：

这似乎工作，虽然我不明白为什么：这条线工作没有问题：tibble(a = 1:5) %>% filter_at(vars("a"), any_vars(. > 4)) 我的猜测是 tidyverse 在 stats 包之前加载，导致 R先找stats::filter。
那是因为filter_at 是 dplyr 的内部函数，所以它不会产生冲突。打开你的 RStudio 并加载 tidyverse，你会发现函数/包之间的冲突。我建议您在使用过滤器、选择等时使用library::，因为它们在多个包（stats、dplyr、data.table 等）中被屏蔽