【问题标题】:Rarefaction with specaccum in R在 R 中使用 specaccum 进行稀疏化
【发布时间】:2015-03-27 10:08:17
【问题描述】:

我对 R 中 specaccumfucntion 中的 rarefaction 方法有疑问。

我有以下数据集

Species1  Species2 Species3 ... Species75
10        20       5        ... 7

我正在尝试绘制一条曲线,其中 x 轴为个体数量,y 轴为物种数量(在上面的示例中,这应该导致 75)。

我试图将其绘制如下:

plot(specaccum(dataset, method="rarefaction", xvar="individuals"))

但我什么也得不到。 有人可以帮我吗?

非常感谢

维克多 D.

【问题讨论】:

    标签: r plot vegan


    【解决方案1】:

    我也遇到了同样的问题,尝试创建一个我用chao1方法的对象,放上你喜欢的,然后分别绘制

    sac

    plot(sac, add = FALSE, random = FALSE, ci = 2, ci.type = c("polygon"), col = par("fg"), xvar = c("individuals"))

    请参阅http://127.0.0.1:12380/library/vegan/html/specaccum.html 确定

    【讨论】:

    • 嘿,我得到了一个情节,但上面没有任何内容,我认为 xvar=c("individuals") 有问题,我使用“个人”一词来表示情节应该基于我上面示例中的值。你如何让 R 使用这些值来构造 x 轴,因为实际上并没有一个名为“个人”的列?谢谢维克多
    猜你喜欢
    • 1970-01-01
    • 1970-01-01
    • 1970-01-01
    • 2017-10-03
    • 2018-05-21
    • 1970-01-01
    • 2013-10-11
    • 1970-01-01
    • 2014-01-31
    相关资源
    最近更新 更多