如何更改 ordiellips 图的图形参数？ Ordielipse 图截断数据

【问题标题】：How to change graphical parameters of ordiellipse plot? Ordiellipse plot cuts off data如何更改 ordiellips 图的图形参数？ Ordielipse 图截断数据
【发布时间】：2018-06-17 17:12:20
【问题描述】：

Ordiellipse plot, part of ellipses are shown in bottom left corner, no other information is shown

我正在尝试创建一个 NMDS 图，其中包含按有无地雷分组的蜜蜂物种数据。在以下代码行中，beematrix=species 丰度按站点和beesmine= 定义了哪些站点包含雷区。

beematrix=read.csv(file.choose(), row.names = 1)
beesmine=read.csv(file.choose(), row.names = 1)
beesmatrix=as.matrix(beematrix)
beematrix=t(beesmatrix)
library(vegan)
rankindex(beematrix, beematrix)
bees.nmds=metaMDS(beematrix, distance = "kulczynski")
for (i in 1:5) print (metaMDS(beesmatrix, distance = "kulczynski", k=i, trace = FALSE)$stress*100)
bees.nmds=metaMDS(beesmatrix, distance = "kulczynski", k=3)
plot(bees.nmds)
plot.new()
ordiellipse(bees.nmds, groups=beesmine$Mine,label = TRUE)
##ordiellipse is smushed into corner of screen and is impossible to read

【问题讨论】：

标签： r plot vegan

【解决方案1】：

不要不要使用plot.new：它会破坏之前的情节和错误ordiellipse。函数ordiellipse 将添加省略号到现有排序图，但是在您使用plot.new() 后您没有现有图，这会破坏所有存在的。

是什么促使您使用plot.new()？

【讨论】：

我之前收到一条错误消息，要求我调用 plot.new()。我只是尝试在没有它的情况下再次运行它，并且效果很好。谢谢。
是的，您必须先plot 排序结果（如plot(bees.nmds)），然后您可以添加带有ordiellipse() 的省略号。如果您还没有绘制排序结果，您会收到一条错误消息，您必须先绘制它，并且该消息要求您“调用 plot.new”（即，使用plot(bees.nmds)）。