【发布时间】：2014-11-05 22:58:16
【问题描述】：
我是多元统计的新手，所以如果这个问题很幼稚，或者我错过了一些重要的事情，请原谅我。
我想知道在使用 adonis 时如何处理不平衡的设计。我有一组河流沉积物中存在的微生物群落和因子流（4 个级别）、US_DS（2 个级别）和季节（2 个级别）（我还有其他因子，但暂时坚持这些）。例如代码如下：
dist.L2<-vegdist(L2, mehod=”bray”)
adonis(dist.L2~Season*Stream*US_DS, data=factors, permutations=199)
不幸的是，设计不平衡（有些站点只有 1 个重复，而其他站点最多 3 个）。
我尝试过运行 adonis，但是因为 anodis 使用 1 型 SS，所以我将因素放入的顺序会产生很大的不同，并且没有理由将一个因素放在其他因素之前。我知道其他统计包通过使用类型 II 或 III 的平方和来解决这个问题，并且无论您使用哪种类型的 SS，都有优点和缺点。我的数据的性质意味着其他更简单的统计测试并不适合。
我想知道如何将 III 型错误与 adonis 一起使用，或者是否有一个程序可以通过使用 I 型错误和 adonis 来找到合适的测试。谢谢
【问题讨论】：