使用 igraph 在提取的自我网络中进行社区检测答案

【问题标题】：Community detection in extracted ego network using igraph使用 igraph 在提取的自我网络中进行社区检测
【发布时间】：2023-04-05 16:46:01
【问题描述】：

我使用安装在 R 软件中的 igraph 库，我想从网络“悲惨世界”中提取一个自我网络。

这是我的代码：

library("igraph")
lesmis<-read.graph("lesmis.gml", format="gml")
gavroche <- graph.neighborhood(lesmis, order = 2, nodes = which(V(lesmis)$label == "Gavroche"))
wc<-infomap.community(gavroche)
plot(wc, gavroche)

我得到这个错误：

infomap.community(gavroche) 中的错误：不是图形对象

这里是 gml 文件的链接： http://www-personal.umich.edu/~mejn/netdata/lesmis.zip

【问题讨论】：

graph.neighborhood 总是返回一个图表列表，因此您需要提取第一个（也是唯一一个）元素。
谢谢，事实上，我想将 Gavroche 的以自我为中心的网络提取为图形，并将检测到的社区显示在输出图形中。

标签： r igraph

【解决方案1】：

我刚刚在寻找其他主题时遇到了这个问题。我发现graph.neighborhood 创建的对象不是图形本身，而是一个列表，它又包含您期望的图形。然后你可以替换：

wc <- infomap.community(gavroche[[1]])
plot(wc, gavroche[[1]])

而且它必须有效。

【讨论】：