为什么 plyr 包不使用我的并行后端？答案

【问题标题】：Why doesn't the plyr package use my parallel backend?为什么 plyr 包不使用我的并行后端？
【发布时间】：2013-03-26 16:46:40
【问题描述】：

我正在尝试使用 R 中的 parallel 包进行并行操作，而不是 doSNOW，因为它是内置的，并且表面上是 R 项目想要的方式。我做错了，但我无法确定。以这个为例：

a <- rnorm(50)
b <- rnorm(50)

arr <- matrix(cbind(a,b),nrow=50)

aaply(arr,.margin=1,function(x){x[1]+x[2]},.parallel=F)

这工作得很好，产生了我的两列的总和。但是如果我尝试引入并行包：

library(parallel)
nodes <- detectCores()
cl <- makeCluster(nodes)
setDefaultCluster(cl)

aaply(arr,.margin=1,function(x){x[1]+x[2]},.parallel=T)

它会抛出错误

2: In setup_parallel() : No parallel backend registered
3: executing %dopar% sequentially: no parallel backend registered

我是不是初始化后端错了？

【问题讨论】：

对于任何看到这篇文章的人来说，我早就放弃了并行，转而支持 doParallel，这似乎只是工作。

标签： r parallel-processing plyr

【解决方案1】：

试试这个设置：

library(doParallel)
library(plyr)

nodes <- detectCores()
cl <- makeCluster(nodes)
registerDoParallel(cl)

aaply(ozone, 1, mean,.parallel=TRUE)

stopCluster(cl)

由于我从未将plyr 用于并行计算，我不知道为什么会发出警告。结果还是正确的。

【讨论】：

【解决方案2】：

aaply 状态的文档

.parallel：如果为“TRUE”，则并行应用函数，使用并行 foreach 提供的后端

所以大概你需要使用foreach 包而不是parallel 包。

【讨论】：