RCaller Java 文件过早结束，即 XML 文件为空答案

【问题标题】：RCaller Java Premature end of file aka XML file is emptyRCaller Java 文件过早结束，即 XML 文件为空
【发布时间】：2013-05-29 16:00:55
【问题描述】：

我正在使用 RCaller 2.1.1-SNAPSHOT 编写程序。问题是当我使用外部库中的代码时，它说 Routput 文件为空。这是我的代码：

  Random random = new Random();


  RCaller caller = new RCaller();
  RCode code = new RCode();

  caller.setRscriptExecutable("C:/Program Files/R/R-2.14.2/bin/x64/Rscript.exe");

  double[] data = new double[100];

  for (int i = 0; i < data.length; i++) {
    data[i] = random.nextGaussian();
  }

  code.addDoubleArray("x", data);

  code.addRCode("setwd('C:/Radek/')");
  code.addRCode("wd=list.files()");
  code.addRCode("library(Biobase)");
  //code.addRCode("targets=read.AnnotatedDataFrame('targets.txt',row.names=1,as.is=TRUE)");// WHEN I USE THIS IT CRASH
  code.addRCode("my.mean<-mean(x)");
  code.addRCode("my.var<-var(x)");
  code.addRCode("my.sd<-sd(x)");
  code.addRCode("my.min<-min(x)");
  code.addRCode("my.max<-max(x)");
  code.addRCode("my.standardized<-scale(x)");

  code.addRCode(
          "my.all<-list(mean=my.mean, variance=my.var, sd=my.sd, min=my.min, max=my.max, std=my.standardized)");
  caller.setRCode(code);
  caller.runAndReturnResult("wd");

  String[] results;
  results = caller.getParser().getAsStringArray("wd");
  System.out.println("Mean is " + results[0]);

我检查了这个： 1. RUniversal 安装并加载 2.下载安装函数使用库。 3 当我将 RCaller 生成的文件中的 rCaller 请求放入 R 时，它可以工作。 4. RScript 路径中的斜线很好，因为我检查了带有注释的问题行的结果，它可以工作。

有人可以帮我解决这个问题吗？

【问题讨论】：

标签： java r rcaller

【解决方案1】：

这一般是关于 package.json 的安装程序和加载程序用户的差异。最新的实验性 RCaller 2.2.0 不需要 Runiversal。如果您的问题仍然存在，您可以试一试，如果问题仍然存在，请在此处写下。您可以点击official blog page of RCaller的链接下载

【讨论】：

【解决方案2】：

在你的代码部分

code.addRCode(
      "my.all<-list(mean=my.mean, variance=my.var, sd=my.sd, min=my.min, max=my.max, std=my.standardized)");
caller.setRCode(code);

String[] results;
results = caller.getParser().getAsStringArray("wd");

更换零件

caller.runAndReturnResult("wd");

到

caller.runAndReturnResult("my.all");

所以你准备好的列表从 R 返回到 Java。然后使用代码

double[] results;
results = caller.getParser().getAsDoubleArray("mean");

最后将返回的平均值打印到屏幕上

System.out.println("Mean is " + results[0]);

【讨论】：