将 R 版本升级到 3.6 破坏了 Shiny 服务器库的访问权限答案

【问题标题】：Upgrading the R version to 3.6 broke the Shiny server libraries access将 R 版本升级到 3.6 破坏了 Shiny 服务器库的访问权限
【发布时间】：2020-06-03 13:19:19
【问题描述】：

我在 Ubuntu 18.04 上，并且有一个闪亮的服务器 1.5.12。

R 版本是 3.4，出于兼容性考虑，我升级到了 3.6.3。

许多软件包抱怨由于版本不兼容而无法加载它们。我浏览了它们中的每一个以重新安装它们。

但是在运行我闪亮的应用程序时，我不断收到以下错误：

这里是 libPaths

> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"      
[3] "/usr/lib/R/library"

我以 root 或闪亮用户的身份删除并重新安装了这个包，但没有成功，并在应用程序内的 Rprofile 中强制 libPath，也没有任何成功。

【问题讨论】：

标签： r shiny

【解决方案1】：

几周前我遇到了同样的问题。对我来说，它帮助我首先更新所有软件包：

update.packages(ask=FALSE, checkBuilt=TRUE)

如果这没有帮助，您可以考虑卸载旧版本，删除站点库并从头开始安装所有内容。在此之前，检索已安装包的向量

installed.packages()[,1]

并将结果保存到文件中。

就我而言，方法 1 update.packages 和添加的一些系统库有所帮助。

【讨论】：