如何为 Rserve 提供新贵服务？答案

【问题标题】：How to make an upstart service to Rserve?如何为 Rserve 提供新贵服务？
【发布时间】：2015-09-09 16:43:55
【问题描述】：

我需要从R 开始并继续运行rserve。

我的rserve.r 文件中有这些行：

library(Rserve)
Rserve()

所以，我正在尝试在我的新贵脚本中做这样的事情：

description "Rserve service"
author      "Valter Silva"

start on filesystem or runlevel [2345]
stop on shutdown

respawn

script
    echo $$ > /var/run/rserve.pid
    exec /usr/bin/R /home/valter/R/rserve.R >> /home/valter/test2.log
end script


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> /var/log/rserve.log
end script

pre-stop script
    rm /var/run/rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> /var/log/rserve.log
end script

我知道服务运行是因为我的文件test2.log 的输出。但它只运行一次。我应该怎么做才能让它继续运行？

【问题讨论】：

“它只运行一次”是什么意思？
@StevenBeaupré 如果我启动 R 命令行并给出命令 library(Rserve) 和 Rserve(); Rserve 保留在 linux 进程列表中。但如果我试图在我的新贵身上做到这一点，什么都不会发生。
尝试使用R CMD Rserve 来启动它？（见rforge.net/Rserve/doc.html#start）
我试过了，但它给了我以下错误：/usr/lib/R/bin/Rcmd: 62: exec: Rserve: not found。
@ValterHenrique 检查这个问题：stackoverflow.com/questions/24370980/…

标签： r rserve

【解决方案1】：

您（和我）遇到这么多麻烦的原因是我们问错了问题。正确的问题是“我们如何从我们的客户端代码启动 Rserve？”Java（和大多数其他）客户端具有 StartRserve 的能力。

这个问题的答案在 java 库中：How to start Rserve automatically from Java?

或者这里是 C# 库： https://github.com/SurajGupta/RserveCLI2/blob/master/RServeCLI2.Test/Rservice.cs

另一种方法是向the best 学习。 Rocker 项目复制supervisor.conf 到/etc/supervisor/conf.d/ （见https://github.com/rocker-org/rocker/blob/master/rstudio/Dockerfile#L61）

你的 supervisor.conf 可以添加类似的东西

[program:Rserve]
command=/usr/bin/Rserve.sh
stdout_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
stderr_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
user=myuser
startsecs=0
autorestart=false
exitcodes=0

但是... 我确实想通了。所以这就是答案。我很抱歉它有点笨拙和分散。对我来说，我最大的障碍是将我的启动/停止脚本放在 /usr/bin 文件夹中（参见下面的讨论）

/etc/init/Rserve.conf

description "Rserve service"
author "Victor I. Wood"
version "0.01"

# based on
# https://stackoverflow.com/questions/32485131/how-to-make-an-upstart-service-to-rserve

env STARTSCRIPT=/usr/bin/Rserve.sh
env STOPSCRIPT=/usr/bin/Rserve.stop
env LOGFILE=/var/log/Rserve.log


start on runlevel [2345]
stop on runlevel [!2345]

console output

respawn

# tell upstart we're creating a daemon
# upstart manages PID creation for you.
expect fork


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> $LOGFILE
    echo $$ > /var/run/Rserve.pid
end script

pre-stop script
    rm /var/run/Rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> $LOGFILE
    exec $STOPSCRIPT >> $LOGFILE
end script


script
        # My startup script, plain old shell scripting here.
        exec $STARTSCRIPT >> $LOGFILE
#       echo $$ > /var/run/rserve.pid
end script

/usr/bin/Rserve.sh

#!/bin/sh
sudo --login --set-home --user=myuser bash -c '~/Rserve.sh >~/Rserve.log 2>&1'

/usr/bin/Rserve.stop

#!/bin/sh
pkill -U myuser Rserve

/home/myuser/Rserve.sh

#!/bin/sh

# launch new Rserve process
R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1

我从脚本开始 https://askubuntu.com/questions/62729/how-do-i-set-up-a-service?lq=1 并注意到initctl start 可能对调试有用。

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1 注意到脚本必须在/bin 中（但我使用了/usr/bin），并且必须归root 所有。有些人喜欢使用其他地方的脚本链接作为脚本 i /bin

作为How to make an upstart service to Rserve?的人们已建议，我正在使用在 rServe 文档中找到的 Rserve 启动命令

R CMD Rserve

虽然我已经将我的扩展为

R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

我没有导出正确的 pid，所以我用 pkill 停止它。更优雅的方法是

RSshutdown(rsc)

How can I shut down Rserve gracefully?

stdout 和 stderr 混淆了新贵，所以用2>&1 重定向所有输出 How to redirect both stdout and stderr to a file

当我找到的时候我有点想通了 https://www.digitalocean.com/community/tutorials/the-upstart-event-system-what-it-is-and-how-to-use-it 和 https://geeknme.wordpress.com/2009/10/15/getting-started-with-upstart-in-ubuntu/ http://blog.joshsoftware.com/2012/02/14/upstart-scripts-in-ubuntu/ 但是对于刚开始的人来说，这些是比官方文档更实用的起点。

更新

此解决方案假定 Upstart，这是最初的问题，但 Upstart 不再是默认的服务管理器。如果您想在 16.04 后的系统上执行此操作，请改回 Upstart with

sudo apt-get install upstart-sysv
sudo update-initramfs -u
sudo apt-get purge systemd

（来自http://notesofaprogrammer.blogspot.com/2016/09/running-upstart-on-ubuntu-1604-lts.html）

【讨论】：

【解决方案2】：

正如 Rserve 的公共文档所述，您可以从 shell 脚本启动 Rserve 守护进程。

只需创建一个执行以下命令的脚本：

echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args="--no-save --slave --RS-conf <your_own_path>/rserve.conf")'|<R_bin_path>/R --no-save --slave

例如，在我的 MacOS 计算机中，我可以启动 Rserve 执行此行：

/bin/sh -c "echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args=\"--slave\")'|/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/bin/exec/R --no-save --slave"

此命令输出如下内容：

Starting Rserve:
  /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rserve/libs//Rserve --slave 

Rserv started in daemon mode.

确保在启动 Rserve 时指定“--slave”参数。

您可以创建一个 shell 脚本（或 windows 脚本）并告诉操作系统在启动过程中执行此脚本。

【讨论】：