r - 将旧的 r 版本包复制到包含新版本包的新文件夹中是否正确？答案

【问题标题】：r - Is it right to copy the old r version packages to the new folder that contains the packages of the new version?r - 将旧的 r 版本包复制到包含新版本包的新文件夹中是否正确？
【发布时间】：2018-05-02 12:37:50
【问题描述】：

我安装了最新版本的 r 3.5.0 并从旧版本 3.4.3 复制了所有包，并将它们粘贴到当前版本文件夹 3.5 我认为这不是复制和粘贴包的好方法，因为 RStudio 要求我重新安装我调用的包。例如，当我安装 zoo 时它给了我这个错误：

Error: package or namespace load failed for ‘zoo’:
package ‘zoo’ was installed by an R version with different internals; it 
needs to be reinstalled for use with this R version

我应该怎么做才能以正确的方式复制它们？

【问题讨论】：

你试过update.packages(check.built=TRUE,ask=FALSE)吗？
您使用的是哪个操作系统？
@BrianStamper Windows
但与@BenBolker 的建议配合得很好。非常感谢。
好的。请注意，它应该是checkBuilt，就像@BrianStamper 的回答一样（但你一定已经弄清楚了）

标签： r package

【解决方案1】：

为较新版本的 R 重新构建包比应对它们要安全得多。

重新构建所有包的最简单方法是将旧版本 R 中的包列表保存在文件中，然后将其加载到新版本 R 中并安装它们：

# In old version of R:
ip <- installed.packages()[,1]
write(ip,"rpackages_in_3.4.3.txt")
q()

# In new version of R:
ip_3.4.3 <- readLines("rpackages_in_3.4.3.txt")
setRepositories(graphics=FALSE, ind=1:6)
install.packages(ip_3.4.3)

还有可能对此有用的软件包 installr： https://cran.r-project.org/web/packages/installr/installr.pdf

【讨论】：

帮助很大。最后一行的更正： install.packages(ip_3.4.3)

【解决方案2】：

至少对于 Windows，也许还有其他人，您所做的加上 @Ben Bolker 的建议正是手册中所说的大多数人应该做的：

对于大多数人来说，最好的办法是 [...] 将任何已安装的包复制到新安装中的库文件夹，在新 R 中运行 update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE) 然后删除旧安装的所有内容。

发件人：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/rw-FAQ.html#What_0027s-the-best-way-to-upgrade_003f

但是，他们也通过说这是“口味问题”来限定这一点，所以如果你找到另一种适合你的方法，我只想指出你尝试的方法是有效的，甚至是由文档。

更新：我刚刚在我自己的系统上更新了 R，因为我为我的包使用了一个固定位置（即路径中没有版本号）我什至没有将它们从一个地方复制到另一个地方，我只做了update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE) 部分，它工作正常。

【讨论】：