如何在 Eclipse 中调试 R 包（使用 C 和 C++ 代码）？答案

【问题标题】：How to debug an R package (with C and C++ code) in Eclipse?如何在 Eclipse 中调试 R 包（使用 C 和 C++ 代码）？
【发布时间】：2014-03-24 17:01:36
【问题描述】：

在 Visual Studio 中，我们可以使用“附加到进程”来调试 DLL。

有什么方法可以在 Eclipse/StatET 中调试 R 包的 C/C++ 代码（例如this example of debugging external code linked to Scilab）？

【问题讨论】：

标签： c++ eclipse r debugging statet

【解决方案1】：

以下步骤适用于 Eclipse-CDT C/C++ (LUNA)。

使用调试信息编译 R (3.2)。使用 SVN 下载源代码的步骤可以在 R 安装指南中找到。

$./configure --enable-R-shlib --with-valgrind-instrumentation=2 --with-system-valgrind-headers --CFLAGS='-g -O0 -fPIC' FFLAGS='-g -O0 -fPIC' CXXFLAGS='-g -O0 -fPIC' FCFLAGS='-g -O0 -fPIC' 
$make
$sudo make install

这将在/usr/local/lib/R 下安装R。

注意：需要 -g 和 -O 来添加调试符号并确保编译优化不会妨碍调试。

为带有 C 源代码的 R 包设置正确的目录结构。使用 makefile 而不是依赖 Eclipse-StatET 来构建项目。使设置更容易移植到 Windows。
在命令行或使用 Makefile 安装 R CMD 会将包安装到用户的本地 R 库。
在 Eclipse (Luna) 下，在 C/C++ 应用程序下创建“新调试配置”。
在“主要”标签下：

一个。选择一个 C/C++ 应用程序：

/usr/local/lib/R/bin/exec/R

b. Project 可能指向 R-package 项目。

c。勾选“将进程输入和输出连接到终端”。

在“参数”标签下使用：

--slave --vanilla --no-save

在“环境”标签下添加：

一个。 LD_LIBRARY_PATH: /use/local/lib/R/lib

b. R_HOME /usr/local/lib/R 选择“将环境附加到本机环境”

在“调试器”标签下

一个。选择 GDB 调试器gdb

b.如果“GDB 命令集”未作为选项显示，请单击最底部的“选择其他...”。选择“旧版创建流程启动器”。这样做现在将显示用于选择 GDB 命令集的选项：Pick Standard with protocol mi。

在“来源”标签下

一个。使用 R 源添加 R 目录的绝对路径（可选）~/Downloads/R

b.添加包 src 目录和任何其他依赖库的绝对路径。

单击调试。

【讨论】：

我认为没有必要用调试模式编译R。我们不会调试 R 本身
好点。这会让事情变得更容易。这是第一步，当我无法获得“调试”符号时，我曾尝试过。我没有弄乱 PKG_CFLAGS 并且想使用 R 默认标志。以前，我无法覆盖 R CFLAGS。
R 包通常是开源的，无论你使用什么包都用调试符号编译它，然后用 gdb 检查它

【解决方案2】：

你应该先运行 R。然后您应该运行该包并将其附加到 R 进程（调试配置 > C/C++ 附加到应用程序）。 R 和 eclipse 都必须以 root 身份运行。

共享库必须是...dll或...so的地址，即R包库。

注意 1：你应该设置 eclipse 来编译一个 R 包。

http://blog.fellstat.com/?p=170

【讨论】：

感谢您的回复。我无法让调试器运行。前面的步骤都很好。