解释 limma 包中的线性模型公式

Question

这是我为线性建模函数构建设计矩阵的代码：

f <- factor(targets$Sample.Name, levels = unique(targets$Sample.Name))
design <- model.matrix(~0 + f)
colnames(design) <- levels(f)

我不确定如何解释公式“~0”。我查找了 ?lm() 并发现如果一个公式有一个隐含的截距项，可以使用 y ~ x - 1 或 y ~ 0 + x 来删除它，但我不确定这是否是相同的情况。

Answer 1

是的，这里的情况相同。您可以检查design 的输出以进行检查。