在集群上安装 rstan

Question

在集群上安装 rstan 时，应该如何选择用于构建的内核数量（在documentation 中描述的Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4" 行中）？如果集群中的每个节点都有 16 个核心，那么将值设置为 16 是否有意义？如果用户想使用 MPI 跨多个节点运行 stan 怎么办？或者在任何情况下将值保持在 4 是否最有意义，因为大多数人无论如何都会并行运行不超过 4 个链？我非常感谢有关此设置的任何建议。

Answer 1

为了完整起见，我在 John 将问题发布到 Stan-users 邮件列表时回答了他的问题。简而言之，在构建时使用多少核心并不重要，您可以在运行时使用 R（或任何其他 Stan 接口）支持的任何并行方案使用任意数量的核心。