如何使用 JDBC/Hive（需要 rJava）构建运行 Shiny 应用程序的 Dockerfile？答案

【问题标题】：How to build a Dockerfile which runs a Shiny app using JDBC/Hive (needs rJava)?如何使用 JDBC/Hive（需要 rJava）构建运行 Shiny 应用程序的 Dockerfile？
【发布时间】：2019-06-06 07:54:45
【问题描述】：

我需要一个 Dockerfile 来运行 能够使用 JDBC 连接到 Hive 的闪亮应用。包 RJDBC 依赖于包 rJava，因此依赖于 Java。现在，我测试了多个选项：

采用rocker/verse，其中包含Java，并手动添加Shiny。
采用rocker/shiny，并手动添加Java。

这两个选项都部分有效，但不是完全有效。 Hive 连接的 R 代码如下：

require(RJDBC)
urlJDBC = "jdbc:hive2://...:8443/;ssl=true;sslTrustStore=./cacerts;trustStorePassword=changeit?hive.server2.transport.mode=http;hive.server2.thrift.http.path=gateway/default/hive"
driver = JDBC("org.apache.hive.jdbc.HiveDriver", "hive-jdbc-standalone.jar", identifier.quote="`")
con = dbConnect(driver, urlJDBC, "username", "password")

我还在 Dockerfile 中添加了带有以下行的 JDBC Jar 文件：

ADD ... ./hive-jdbc-standalone.jar

但是，我没有成功让它运行。有人有与 Shiny 和 Hive/JDBC 一起使用的蓝图 DOCKERFILE 吗？会很棒

【问题讨论】：

标签： r docker hive shiny rjdbc

【解决方案1】：

在错误的方向上几个小时后解决了。

问题在于权限管理。 缺少对 JAR 文件的读取权限。

新的 DOCKERFILE 非常简单：

FROM rocker/shiny

# Download and rename JAR file with JDBC HIVE driver.
WORKDIR /srv/shiny-server/apps/shinyhive
ADD <..jar-on-local-server..> ./hive-jdbc-standalone.jar

RUN apt-get update && apt-get install -y \
    openjdk-8-jdk liblzma-dev libbz2-dev libicu-dev libssl-dev \
    && R CMD javareconf

RUN R -e "install.packages('RJDBC', repos='http://cran.r-project.org')"

RUN chmod 777 -R .
COPY . .
COPY ./shiny-server.sh /usr/bin/shiny-server.sh

EXPOSE 3838

CMD ["/usr/bin/shiny-server.sh"]

【讨论】：