【发布时间】：2013-04-24 10:58:57
【问题描述】：
我正在使用dist {stats} 函数来计算点之间的距离，我的问题是我有 24469 个点，并且 dist 函数的输出给了我一个长度为 18705786 的向量，而不是矩阵。我已经尝试导出as.matrix，但文件是 2 大。
我怎样才能获得每个距离对应的点？
例如which(distance<=700) 给了我在向量中的位置，但是我怎样才能得到这个距离对应的点的信息呢？
【问题讨论】：
标签： r
【发布时间】：2013-04-24 10:58:57
【问题描述】：
您可以尝试一些事情，具体取决于您的具体需求：
- 计算循环中的距离，并仅保留符合标准的距离。尤其是当匹配的数量远小于距离矩阵的总大小时，这样可以节省大量的 RAM 使用量。如果这个循环在纯 R 中实现，它可能会非常慢，这也是为什么
dist不使用 R 但我相信 C 来执行计算。这可能意味着您获得了结果，但必须等待一段时间。或者，出色的Rcpp包可以让您用 C/C++ 写下来，这可能会快得多。 - 开始使用像
bigmemory这样的包来存储距离矩阵。然后你在一个循环中构建它并将它迭代地存储在 bigmemory 对象中（我以前没有使用过 bigmemory，所以我不知道确切的细节）。然后在构建矩阵之后，您可以访问它以提取您想要的结果。实际上，在 R 中处理大数据的所有技巧都适用于这个项目符号。参见例如R SO posts on big data。
一些有趣的链接（在谷歌上搜索r distance matrix for large vector）：
【讨论】：