如何使用 R 更改我的表 [重复]答案

【问题标题】：How can I use R to change my table [duplicate]如何使用 R 更改我的表 [重复]
【发布时间】：2018-05-02 12:19:31
【问题描述】：

使用 R 我将如何改变我的表：

GeneID    GeneName    Species    Paralogues    Domains    Total
 1234      FGF1        Human         4            2         6
 5678      FGF1        Mouse         2            1         3
 9104      FGF1       Chicken        3            0         3

到代表总列的表格，例如

GeneName    Human    Mouse    Chicken
  FGF1        6        3         3

【问题讨论】：

到目前为止你有什么尝试？
@Sathish 这不会重现 OP 的预期输出；你自己试过吗？
@MauritsEvers 可能是这个dcast(df, GeneName ~ Species, value.var = 'Total')

标签： r dataframe biomart

【解决方案1】：

你可以使用dplyr::spread从长变宽：

library(tidyverse);
df %>% 
    select(GeneName, Species, Total) %>% 
    spread(Species, Total)
#  GeneName Chicken Human Mouse
#1     FGF1       3     6     3

样本数据

df <- read.table(text =
    "GeneID    GeneName    Species    Paralogues    Domains    Total
 1234      FGF1        Human         4            2         6
 5678      FGF1        Mouse         2            1         3
 9104      FGF1       Chicken        3            0         3", header  = T)

【讨论】：

不需要group_by。
@zx8754 好点，谢谢。固定。

【解决方案2】：

您可以从data.table 使用dcast()。

对于输入：

text <- 
    "GeneID    GeneName    Species    Paralogues    Domains    Total
     1234      FGF1        Human         4            2         6
     5678      FGF1        Mouse         2            1         3
     9104      FGF1       Chicken        3            0         3"

my_data <- read.table(text = text, header = TRUE)

您可以使用GeneName 将数据转换为LHS，将Species 转换为RHS 和value.var Total：

data.table::dcast(my_data,
                  GeneName ~ Species, 
                  value.var = "Total")

结果：

  GeneName Chicken Human Mouse
1     FGF1       3     6     3

【讨论】：