【问题标题】:How to efficiently upload data from R to SQL Database (Snowflake)?如何有效地将数据从 R 上传到 SQL 数据库(雪花)?
【发布时间】:2020-04-17 13:52:11
【问题描述】:

我想创建一个函数,以尽可能高效地将可能较大的数据帧(1M + 行)从 R 上传到 Snowflake。下面的代码是我目前的方法,我将数据帧分成 100 条记录的块,并通过 dbSendUpdate 循环遍历 100 行的迭代,加上其余的。对于大型数据框,这通常需要很长时间,有没有更有效的方法可以代替?

upload_func <- function (dataframe) {
for (i in 0:(nrow(dataframe)/100 - (nrow(dataframe)/100)%%1)) {
  if (100*(i + 1) <= nrow(dataframe)) {

    b <- 100*i + 1
    e <- 100*(i + 1)

    values <- paste0(apply(dataframe[b:e,], 1, function(x) paste0("('", paste0(x, collapse = "', '"), "')")), collapse = ", ")

    dbSendUpdate(connection, paste0("INSERT INTO database_table
                                  VALUES ", values, ";"))
  }

  else {
    values <- paste0(apply(dataframe[(i*100 + 1):(i*100 + nrow(dataframe)%%100), ], 1, function(x) paste0("('", paste0(x, collapse = "', '"), "')")), collapse = ", ")

    dbSendUpdate(connection, paste0("INSERT INTO database_table 
                                  VALUES ", values, ";"))
  }
}

}

【问题讨论】:

  • 不确定 R 但您根本不应该使用循环进行插入。使用 Snowflake 提供的本机函数,例如 COPY INTO...etc,这将更有效。如果这不起作用,那么另一种方法是使用单个 insert 语句批量插入
  • 我注意到 dbSendUpdate 能够发送的记录数有限制,因此会出现循环。你知道批量插入是否受到同样的影响吗?
  • @mad_ 对COPY INTO 的建议是将数据最快地导入 Snowflake 的正确方法。让 R 将数据放到 blob 存储上的文件中,然后使用 COPY INTO 将其放入 Snowflake。任何形式的INSERT 语句都不会那么有效,尤其是对于较大的数据集。

标签: python sql r database snowflake-cloud-data-platform


【解决方案1】:

要获得最佳性能,请不要直接从 R 插入。将数据帧写入云存储中的 csv 文件,创建指向此位置的外部阶段,然后使用 COPY INTO。这将利用并行处理来摄取数据。为了优化负载的并行操作数,建议生成大约 100-250 MB 的压缩数据文件。

【讨论】:

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