使用 RJDBC 连接 R 和 Netezza答案

【问题标题】：Connect R and Netezza using RJDBC使用 RJDBC 连接 R 和 Netezza
【发布时间】：2014-03-10 14:06:25
【问题描述】：

我正在尝试使用 JDBC 驱动程序将 R 与 Netezza 连接起来。

我成功连接数据库，但结果不正确。

# Here are the connection details
library(RJDBC)
drv <- JDBC(driverClass="org.netezza.Driver", classPath = "C://JDBC//nzjdbc.jar", "'")
con <- dbConnect(drv, "jdbc:netezza://10.206.0.66:5480//DBASE", "USER", "PASS")

# > con
# An object of class "JDBCConnection"
# Slot "jc":
# [1] "Java-Object{org.netezza.sql.NzConnection@bce3d7}"

# Slot "identifier.quote":
# [1] "'"

res <- dbSendQuery(con, "SELECT * FROM DBASE.MARBEL.DATOS limit 10000;")
res <- fetch(res, n = -1)

问题是这些字段被返回为带有“垂直”变量的列表，而不是表格的列！

head(res)

SUBSCRIPTION_ID
1 245206318120314                                                                                                                                                                                                                                                
2 235109338101206                                                                                                                                                                                                                                                
3 238463669110624                                                                                                                                                                                                                                                
4 214177015090830                                                                                                                                                                                                                                                
5 212403495090830                                                                                                                                                                                                                                                
6 13874138618090824                                                                                                                                                                                                                                              
                                                                                                                                                                                                                                                   SUB_ACCOUNT_ID
1 MV_SUBCTA_45206318_20120316                                                                                                                                                                                                                                    
2 MV_SUBCTA_35109338_20101207                                                                                                                                                                                                                                    
3 MV_SUBCTA_38463669_20110627                                                                                                                                                                                                                                    
4 MV_SUBCTA_45223848_20120316                                                                                                                                                                                                                                    
5 MV_SUBCTA_12403495_20081224                                                                                                                                                                                                                                    
6 MV_SUBCTA_18932919_20091012                                                                                                                                                                                                                                    
                                                                                                                                                                                                                                                       ACCOUNT_ID
1 MV_CTA_44123765_20120316                                                                                                                                                                                                                                       
2 MV_CTA_35213277_20101207                                                                                                                                                                                                                                       
3 MV_CTA_37772612_20110627                                                                                                                                                                                                                                       
4 MV_CTA_14217213_20090330                                                                                                                                                                                                                                       
5 MV_CTA_12477560_20081224                                                                                                                                                                                                                                       
6 MV_CTA_18758944_20091012                                                                                                                                                                                                                                       
                                                                                                                                                                                                                                                 ACCESS_METHOD_ID
1 1167391804                                                                                                                                                                                                                                                     
2 1159354610                                                                                                                                                                                                                                                     
3 2966407995                                                                                                                                                                                                                                                     
4 1153360304                                                                                                                                                                                                                                                     
5 1131960835                                                                                                                                                                                                                                                     
6 3874138618

知道如何解决这个问题吗？我有一个有效的 ODBC 连接，但我宁愿使用 JDBC。

【问题讨论】：

你是怎么得到“res”的？你能发布缺少的代码+表定义吗？
我已经添加了缺失的内容。该表有 70 列不同的数据类型。由于输出的格式，在 SO 中复制粘贴需要几页。由于我经常成功地将 RJDBC 与 Teradata 一起使用，因此 R 连接到 netezza 的方式似乎存在问题。

标签： r jdbc netezza

【解决方案1】：

我将您的输出一直滚动到右侧，看起来您列中的字符串非常宽（它们是 CHAR 而不是 VARCHAR？），因此结果不适合 R 控制台的宽度。因此 R 以这种方式显示它们。

所以尝试在您的查询中修剪它们

select rtrim(SUB_ACCOUNT_ID), ...

或在 R 中：

require('stringr')
res$SUB_ACCOUNT_ID <- str_trim(res$SUB_ACCOUNT_ID)

【讨论】：

【解决方案2】：

根据 Alex 的回答，我编写了这个函数以在所有变量中使用 rtrim。

query_nzz <- function(con, select="select * ", from="", where = "", limit = " 10000; "){
  options(scipen=666)

  # Get variable Names
  query_names = paste(select, " from ",from, where, sep = " ")
  names <- dbGetQuery(con, paste(query_names,"limit 1;", sep= " "))
  names <- names(names)

  # Trim spaces
  select <- paste0("trim(",names,") as ", names, collapse = ",")

  query = paste0("select ", select, " from ", from, where, " limit ",deparse(limit),";")
  data = dbGetQuery(con, query)
  data
}

函数使用

  dt <- query_nzz(
    con,
    select = "select * ",
    from = "DATABASE.TABLENAME",
    where = "",
    limit = 100000
  )

【讨论】：

试试paste0('trim(', names, ') as ', names, collapse = ', ')，而不是循环。