您采用的具体方法可能因您的 ODBC 驱动程序而异。我将演示如何在 MS SQL Server 上执行此操作,希望您可以根据自己的需要进行调整。
我将在我的数据库中使用一个名为 InsertFile 的表,其定义如下:
CREATE TABLE [dbo].[InsertFile](
[OID] [int] IDENTITY(1,1) NOT NULL,
[filename] [varchar](50) NULL,
[filedata] [varbinary](max) NULL
) ON [PRIMARY] TEXTIMAGE_ON [PRIMARY]
GO
现在让我们创建一个我们将推送到数据库中的文件。
file <- "hello_world.txt"
write("Hello world", file)
我需要做一些工作来准备这个文件的字节码以进入 SQL。我为此使用了这个功能。
prep_file_for_sql <- function(filename){
bytes <-
mapply(FUN = readBin,
con = filename,
what = "raw",
n = file.info(filename)[["size"]],
SIMPLIFY = FALSE)
chars <-
lapply(X = bytes,
FUN = as.character)
vapply(X = bytes,
FUN = paste,
collapse = "",
FUN.VALUE = character(1))
}
现在,这有点奇怪,但SQL Server ODBC 驱动程序非常擅长写入VARBINARY 列,但读取它们却很糟糕。
巧合的是,SQL Server Native Client 11.0 ODBC 驱动程序在写入 VARBINARY 列时很糟糕,但在读取它们时还可以。
所以我将有两个 RODBC 对象,conn_write 和 conn_read。
conn_write <-
RODBC::odbcDriverConnect(
paste0("driver=SQL Server; server=[server_name]; database=[database_name];",
"uid=[user_name]; pwd=[password]")
)
conn_read <-
RODBC::odbcDriverConnect(
paste0("driver=SQL Server Native Client 11.0; server=[server_name]; database=[database_name];",
"uid=[user_name]; pwd=[password]")
)
现在我将使用参数化查询将文本文件插入到数据库中。
sqlExecute(
channel = conn_write,
query = "INSERT INTO dbo.InsertFile (filename, filedata) VALUES (?, ?)",
data = list(file,
prep_file_for_sql(file)),
fetch = FALSE
)
现在使用参数化查询将其读回。在这里使用的令人不快的技巧是将您的 VARBINARY 属性重铸为 VARBINARY(不要问我为什么,但它有效)。
X <- sqlExecute(
channel = conn_read,
query = paste0("SELECT OID, filename, ",
"CAST(filedata AS VARBINARY(8000)) AS filedata ",
"FROM dbo.InsertFile WHERE filename = ?"),
data = list("hello_world.txt"),
fetch = TRUE,
stringsAsFactors = FALSE
)
现在你可以用
查看内容了
unlist(X$filedata)
并用
写入文件
writeBin(unlist(X$filedata),
con = "hello_world2.txt")
大危险警告
您需要注意文件的大小。我通常将文件存储为VARBINARY(MAX),而 SQL Server 对通过 ODBC 导出这些文件不是很友好(我不确定其他 SQL 引擎;有关详细信息,请参阅RODBC sqlQuery() returns varchar(255) when it should return varchar(MAX))
我发现解决此问题的唯一方法是将VARBINARY(MAX) 重铸为VARBINARY(8000)。如果文件中有超过 8000 个字节,这显然是一个糟糕的解决方案。当我需要解决这个问题时,我不得不遍历VARBINARY(MAX) 列并创建多个长度为 8000 的新列,然后将它们全部粘贴到 R 中。(查看:Reconstitute PNG file stored as RAW in SQL Database)
到目前为止,我还没有想出一个通用的解决方案来解决这个问题。不过,也许这是我应该花更多时间做的事情。