openCPU 和 rstan - 无法打开连接答案

【问题标题】：openCPU and rstan - cannot open the connectionopenCPU 和 rstan - 无法打开连接
【发布时间】：2016-11-10 15:55:16
【问题描述】：

我正在使用 openCPU 创建一个 API 来估计 rstan 中非常基本的模型。

我已经验证，当从普通 R 控制台会话调用时，我的函数在我的环境中工作，而不是从 openCPU 调用。

但是通过openCPU调用时，响应如下：

cannot open the connection

In call:
file(con, "r")

通过在 rstan 的源代码中插入检查点，我将其追溯到 R/cxxfunplus.R (link to line on github here) 中的一个调用：

dso <- new('cxxdso', sig = sig, dso_saved = save_dso, 
             dso_filename = dso_filename, 
             modulename = module_name, 
             system = R.version$system, 
             cxxflags = get_makefile_flags("CXXFLAGS"), 
             .CXXDSOMISC = new.env(parent = emptyenv()))

此调用中的什么试图读取可能失败的连接？

【问题讨论】：

标签： r opencpu stan rstan

【解决方案1】：

想通了——rstan::get_makefile_txt 正在寻找的两个 makefile 之一在 openCPU 下运行时不存在。该文件是/usr/share/R/share/make。

幸运的是，第一个 makefile 确实存在并且足够了，因此可以通过跳过第二个 makefile 并仅读取第一个来纠正此问题。

在rstan::get_makefile_text的最后一行之前，我插入了以下内容：

makefiles <- makefiles[file.exists(makefiles)]

【讨论】：

感谢您告知我们。你可以添加到你的答案中，无论你叫什么只读取第一个 makefile？
好的。我将该行添加到 GitHub 上 rstan 的开发分支。