将多个整数列读取为字符串，尝试 gsub 并转换回整数答案

【问题标题】：Read multiple integer columns as string, trying to gsub and convert back to integer将多个整数列读取为字符串，尝试 gsub 并转换回整数
【发布时间】：2018-04-05 20:25:20
【问题描述】：

我在超过 100 列的数据框中有大约 30 列。我正在读取的文件将其数字存储为字符。换句话说，1300 是 1300，R 认为它是一个字符。

我正在尝试通过将"," 替换为空并将该字段转换为整数来解决该问题。我不想在每个有问题的列上使用gsub。我宁愿将列存储为有问题的向量，然后对所有列执行一个函数或 loop。

我尝试过使用lapply，但不确定将什么作为“x”变量。

这是我的函数，下面有错误

ItemStats_2014[intColList] <- lapply(ItemStats_2014[intColList],
    as.integer(gsub(",", "", ItemStats_2014[intColList])) )

[.data.table(ItemStats_2014, intColList) 中的错误：当 i 是 data.table（或字符向量），连接的列必须是使用 'on=' 参数（参见 ?data.table）或通过键入 x 指定（即已排序，并且，标记为已排序，请参见 ?setkey）。键控连接可能由于 x 已排序，因此对非常大的数据具有进一步的速度优势在内存中。

【问题讨论】：

一开始就不要将整数读入字符串，而是将它们读入整数； fread() 将逗号理解为小数分隔符
未来，就lapply本身而言，您可以在lapply调用中定义函数，如下所示：lapply(ItemStats_2014[intColList], function(x) as.integer(gsub(",", "", x)))
嘿，我给了你正确的编程答案，包括如何以编程方式轻松找到 colClasses，即使在 100 列 dfs 上也是如此。这是可扩展的，并且不会泄漏内存和浪费 CPU，这与不必要地将整数读取为字符串然后进行转换不同。查看 gc() 以了解您在数字字符串上浪费了多少内存。

标签： r file-io gsub fread number-formatting

【解决方案1】：

我正在读取的文件将其数字存储为字符[用逗号作为小数分隔符]

直接以十进制读取这些列，而不是字符串： data.table::fread() 理解小数点分隔符：dec=',' 默认情况下。

您可能需要稍微使用fread(..., colClasses=(...) ) 参数来指定整数列：

myColClasses <- rep('string',100) # for example...
myColClasses[intColList] <- 'integer'
# ...any other colClass fixup as needed...
ItemStats_2014 <- fread('your.csv', colClasses=myColClasses)

这种方法比读取为字符串然后再转换更简单、更快，并且使用的内存要少得多。

【讨论】：

这是一个很好的情报，可能会奏效，我喜欢这个答案，但是有很多列我会花很多时间来整理。
@alexb523: 所以试试fread(..., nrows=100)。然后使用myColClasses <- sapply(df, class) 获取colClasses 的命名向量。您可以使用as.vector() 和names() 分别获取组件。根据需要修复它，将其放入您的代码中，然后使用fread('your.csv', colClasses=myColClasses) 重新读取。相信我，它会让你的生活变得理智。这不需要时间，您可以通过编程方式完成。（顺便说一句，CSV 列通常具有命名约定，因此您可以从它们的名称中推断出它们的类型，使用 grep 或 grepl 或 gsub()）
没有“可能”，我已经这样做多年了。只需学习一次，永不回头。
有帮助的：Programmatically determine the data types of a data frame's columns
谢谢！我一直在寻找只是叫出列名和类。效果很好。

【解决方案2】：

尝试使用dplyr::mutate_at() 选择多个列并对它们应用转换。

ItemStats_2014 <- ItemStats_2014 %>%
    mutate_at(intColList, funs(as.integer(gsub(',', '', .))))

mutate_at 从列表中选择列或使用 dplyr 选择器函数（请参阅?select_helpers）然后将一个或多个函数应用于每一列。 gsub 中的. 指的是mutate_at 传递给它的每个选定列。你可以把它想象成function(x) ...中的x。

【讨论】：