【问题标题】:Add column with closest vaues to PySpark Dataframe将具有最接近值的列添加到 PySpark Dataframe
【发布时间】:2019-10-11 05:35:32
【问题描述】:

我有一个 PySpark 数据框(比如 df),它有两列(NameScore)。以下是数据框的示例:

+------+-----+
|  Name|Score|
+------+-----+
| name1|11.23|
| name2|14.57|
| name3| 2.21|
| name4| 8.76|
| name5|18.71|
+------+-----+

我有一个 numpy 数组(比如 bin_array),它的值接近 PySpark 数据框的标题为 Score 的列中的数值。

下面是前面提到的numpy数组:

bin_array = np.array([0, 5, 10, 15, 20])

我想Score 列中每一行的值与bin_array 中的值进行比较,并将最接近的值(从bin_array 获取)存储在 PySpark 数据框中的单独列中。

下面是我希望我的新数据框(比如df_new)的外观。

+------+-----+------------+
|  Name|Score| Closest_bin|
+------+-----+------------+
| name1|11.23|      10.0  |
| name2|14.57|      15.0  |
| name3| 2.21|       0.0  |
| name4| 8.76|      10.0  |
| name5|18.71|      20.0  |
+------+-----+------------+

我有下面提到的函数,它给了我最接近 bin_array 的值。当我用单独的数字测试它时,该功能可以正常工作。

def find_nearest(array, value):
    array = np.asarray(array)
    idx = (np.abs(array - value)).argmin()
    return float(array[idx])

在我的实际工作中,我会在datafrmae 中有数百万行。 创建df_new 的最有效方法是什么?

以下是我尝试用来创建用户定义函数 (udf) 和新数据框 (df_new) 的步骤。

closest_bin_udf = F.udf( lambda x: find_nearest(array, x) )
df_new = df.withColumn( 'Closest_bin' , closest_bin_udf(df.Score)  )

但是,当我尝试df_new.show() 时出现错误。部分错误如下所示。

---------------------------------------------------------------------------
Py4JJavaError                             Traceback (most recent call last)
<ipython-input-11-685c9b7e25d9> in <module>()
----> 1 df_new.show()

/usr/lib/spark/python/pyspark/sql/dataframe.py in show(self, n, truncate, vertical)
    376         """
    377         if isinstance(truncate, bool) and truncate:
--> 378             print(self._jdf.showString(n, 20, vertical))
    379         else:
    380             print(self._jdf.showString(n, int(truncate), vertical))

您可以使用下面提到的步骤来创建上述数据框:

from pyspark.sql import *
import pyspark.sql.functions as F
import numpy as np

Stats = Row("Name", "Score")

stat1 = Stats('name1', 11.23)
stat2 = Stats('name2', 14.57)
stat3 = Stats('name3', 2.21)
stat4 = Stats('name4', 8.76)
stat5 = Stats('name5', 18.71)

stat_lst = [stat1 , stat2, stat3, stat4, stat5]
df = spark.createDataFrame(stat_lst)

df.show()

【问题讨论】:

    标签: python dataframe pyspark pyspark-sql pyspark-dataframes


    【解决方案1】:

    您可以使用来自pyspark.mllibbucketizer

    from pyspark.sql import *
    import pyspark.sql.functions as F
    import numpy as np
    
    Stats = Row("Name", "Score")
    
    stat_lst = [Stats('name1', 11.23) , Stats('name2', 14.57), Stats('name3', 2.21), Stats('name4', 8.76), Stats('name5', 18.71)]
    df = spark.createDataFrame(stat_lst)
    
    from pyspark.ml.feature import Bucketizer
    
    """
    Bucketizer creates bins like 0-5:0, 5-10:1, 10-15:2, 15-20:3
    As I see, your expected output wants the closest numbered bin, so you might 
    have to change your buckets or the variable `t` below accordingly.
    """
    bucket_list = [0, 5, 10, 15, 20]
    
    bucketizer = Bucketizer(splits=bucket_list, inputCol="Score", outputCol="buckets")
    df_buck = bucketizer.setHandleInvalid("keep").transform(df)
    
    df_buck.show()
    

    我仍在努力寻找最近的垃圾箱,我会更新我的答案。

    如果您想要每个存储桶的数组值,您可以使用 udf 创建一个包含存储桶名称的新列

    from pyspark.sql.functions import udf
    from pyspark.sql.types import *
    
    t = dict(zip(range(len(bucket_list)), bucket_list))
    udf_foo = udf(lambda x: t[x], IntegerType())
    df_buck = df_buck.withColumn("score_bucket", udf_foo("buckets"))
    

    输出

    >>> df_buck.show()
    
    +-----+-----+-------+------------+
    | Name|Score|buckets|score_bucket|
    +-----+-----+-------+------------+
    |name1|11.23|    2.0|          10|
    |name2|14.57|    2.0|          10|
    |name3| 2.21|    0.0|           0|
    |name4| 8.76|    1.0|           5|
    |name5|18.71|    3.0|          15|
    +-----+-----+-------+------------+
    

    编辑:更正分数桶:

    # Not dynamic, but please try to figure out this business logic according to your use-case
    df_buck = df_buck.withColumn("correct_buckets", F.when(df_buck.Score-df_buck.score_bucket > 5/2, F.col("score_bucket") + 5).otherwise(F.col("score_bucket"))).drop("buckets", "score_bucket")
    

    现在输出符合预期:

    +-----+-----+---------------+
    | Name|Score|correct_buckets|
    +-----+-----+---------------+
    |name1|11.23|             10|
    |name2|14.57|             15|
    |name3| 2.21|              0|
    |name4| 8.76|             10|
    |name5|18.71|             20|
    +-----+-----+---------------+
    

    【讨论】:

    • 非常好的帖子@pisall:我能够很好地运行代码直到最后一行df_buck.show()。当 df_buck.show() 尝试执行 df_buck = df_buck.withColumn("score_bucket", udf_foo("buckets")) 时,我收到以下错误:``` 19 df_buck = df_buck.withColumn( "kk_bucket", udf_nearest_bin("buckets") ) ---> 20 df_buck.show() /usr /lib/spark/python/pyspark/sql/dataframe.py in show(self, n, truncate, vertical) 377 if isinstance(truncate, bool) and truncate: --> 378 print(self._jdf.showString(n, 20, 垂直))```
    • @SiddharthSatpathy 无法理解,这是非常小的信息。我需要Py4JErrorAnalysisException 之后的错误。如果您喜欢使用编辑,可以将其添加到您的问题中
    • 我能够解决这个错误。感谢这个很棒的答案。 =)
    【解决方案2】:

    您也可以pandas_udf,尽管我建议您在扩大规模时测试速度和内存消耗

    from pyspark.sql.functions import pandas_udf, PandasUDFType
    import numpy as np
    import pandas as pd
    df = spark.createDataFrame(zip(["name_"+str(i) for i in range(1,6)], [11.23, 14.57, 2.21, 8.76, 18.71]), ["Name", "Score"])
    
    bin_array = np.array([0, 5, 10, 15, 20])
    
    @pandas_udf('double', PandasUDFType.SCALAR)
    def find_nearest(value):
        res = bin_array[np.newaxis, :] - value.values[:, np.newaxis]
        ret_vals = [bin_array[np.argmin(np.abs(i))] for i in res]
        return pd.Series(ret_vals)
    
    df.withColumn('v2', find_nearest(df.Score)).show()
    

    输出

    +------+-----+----+
    |  Name|Score|  v2|
    +------+-----+----+
    |name_1|11.23|10.0|
    |name_2|14.57|15.0|
    |name_3| 2.21| 0.0|
    |name_4| 8.76|10.0|
    |name_5|18.71|20.0|
    +------+-----+----+
    

    【讨论】:

    • 你有没有机会看到函数如何随着更大的数据进行缩放?
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